如何在python中使用正则表达式？

Question

希望有人可以提供帮助，我正在尝试使用正则表达式从模式之后的字符串中提取某些东西，但它不起作用，我不知道为什么。正则表达式在linux中运行良好......

import re
s = "GeneID:5408878;gbkey=CDS;product=carboxynorspermidinedecarboxylase;protein_id=YP_001405731.1"
>>> x = re.search(r'(?<=protein_id=)[^;]*',s)
>>> print(x)
<_sre.SRE_Match object at 0x000000000345B7E8>

Answer 1

在搜索结果上使用.group()来打印捕获的组：

>>> print(x.group(0))
YP_001405731.1

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正如Martijn 已经指出，你创建了一个匹配对象。正则表达式是正确的。如果错误，print(x)会打印None。

Answer 2

您应该考虑重新编写正则表达式，以便找到所有对，这样您就不必使用特定的组和硬编码的外观... ...

import re
kv = dict(re.findall('(\w+)=([^;]+)', s))
# {'gbkey': 'CDS', 'product': 'carboxynorspermidinedecarboxylase', 'protein_id': 'YP_001405731.1'}
print kv['protein_id']
# YP_001405731.1