RcppArmadillo中的QR分解

时间:2012-06-09 19:43:46

标签: r rcpp decomposition armadillo

真的很困惑为什么使用RcppArmadillo的QR输出与R的QR输出不同;犰狳文献也没有给出明确的答案。基本上当我给R一个n * q的矩阵Y(比如1000 X 20)时,我得到的Q是1000 X 20和R 20 X 1000.这就是我需要的。但是当我在Armadillo中使用QR求解器时,它会让我回到Q 1000 X 1000和R. 1000 X 20.我可以调用R的qr函数吗?我需要Q的维数为n x q,而不是q x q。下面的代码是我正在使用的(它是更大功能的一部分)。

如果有人可以建议如何在RcppEigen中做到这一点,那也会有所帮助。

library(inline)
library(RcppArmadillo)

src <- '
    Rcpp::NumericMatrix Xr(Xs);
    int q = Rcpp::as<int>(ys);

    int n = Xr.nrow(), k = Xr.ncol();
    arma::mat X(Xr.begin(), n, k, false);

    arma::mat G, Y, B;

    G = arma::randn(n,q);

    Y = X*G;

    arma::mat Q, R;
    arma::qr(Q,R,Y);

    return Rcpp::List::create(Rcpp::Named("Q")=Q,Rcpp::Named("R")=R,Rcpp::Named("Y")=Y);'


rsvd <- cxxfunction(signature(Xs="numeric", ys="integer"), body=src, plugin="RcppArmadillo")

1 个答案:

答案 0 :(得分:6)

(注意:这个答案解释了为什么R和RcppArmadillo返回具有不同维度的矩阵,而不是如何使RcppArmadillo返回R所做的1000 * 20矩阵。为此,或许可以看一下底部附近使用的策略。 qr.Q()函数定义。)


R的qr()函数不直接返回Q.为此,您需要使用qr.Q(),如下所示:

m <- matrix(rnorm(10), ncol=2)
qr.Q(qr(m))
#             [,1]        [,2]
# [1,] -0.40909444  0.05243591
# [2,]  0.08334031 -0.07158896
# [3,]  0.38411959 -0.83459079
# [4,] -0.69953918 -0.53945738
# [5,] -0.43450340  0.06759767

请注意qr.Q()返回与m相同维度的矩阵,而不是完整的5 * 5 Q矩阵。您可以使用complete=参数来控制此行为,并获取完整维度的Q矩阵:

qr.Q(qr(m), complete=TRUE)
#             [,1]        [,2]       [,3]       [,4]        [,5]
# [1,] -0.40909444  0.05243591  0.3603937 -0.7158951 -0.43301590
# [2,]  0.08334031 -0.07158896 -0.8416121 -0.5231477  0.07703927
# [3,]  0.38411959 -0.83459079  0.2720003 -0.2389826  0.15752300
# [4,] -0.69953918 -0.53945738 -0.2552198  0.3453161 -0.18775072
# [5,] -0.43450340  0.06759767  0.1506125 -0.1935326  0.86400136

在你的情况下,听起来RcppArmadillo正在返回完整的1000x1000 Q矩阵(如qr.Q(q(m, complete=FALSE))那样),而不仅仅是它的前20列(如qr.Q(q(m))那样)。

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