无法在ubuntu 11.10中安装rdkit

时间:2012-06-25 15:08:06

标签: python ubuntu rdkit

我花了很多时间尝试在ubuntu 11.10上构建RDKit Python 2.7(rdkit_201106 + dfsg.orig.tar.gz)使用预编译版本 提升1.49。我悲惨地失败了。

重复出错的错误发生在CMake GUI中:

 CMake Error at CMakeLists.txt:11 (install):

  install FILES given no DESTINATION!



  CMake Error at CMakeLists.txt:14 (add_pytest):


  Unknown CMake command "add_pytest".

请帮忙吗?

解决了上一个问题,但现在运行python时遇到此错误,即使我按照安装过程安装了rdkit:

 from rdkit import Chem
 Traceback (most recent call last):
   File "<stdin>", line 1, in <module>
 ImportError: No module named rdkit

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

确保设置了环境变量: (你可能需要用你拥有的东西来修复路径):在mac上使用bash:

export RDBASE=/usr/local/share/RDKit
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/usr/local/lib/python2.7/site-packages

您可能希望将这些行添加到bash脚本中以自动执行该过程。

答案 1 :(得分:1)

对于Ubuntu 12.04.2 LTS设置,此环境变量适用于我

export RDBASE=/usr/share/RDKit
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/usr/lib/pymodules/python2.7
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