Question

我有一个其他人编码的matlab脚本，但无法加载超过4095的字符串序列（缓冲区大小错误）。如何使struct中的元素更大以容纳更大的字符串序列？以下是创建struct：

的代码

    [...]
    seq = struct('Header',{}, 'Sequence', {});
    for ii=1:gene_num
        seq(ii).Header = raw{ii+1,1};
        seq(ii).Sequence = raw{ii+1,2};
    end;
    [...]

这是错误：

^G??? Buffer overflow (bufsize = 4095) while reading string from
file (row 54660, field 1). Use 'bufsize' option. See HELP TEXTREAD.

Error in ==> textread at 177
[varargout{1:nlhs}]=dataread('file',varargin{:});

Error in ==> fastaread at 101
    ftext = textread(filename,'%s','delimiter','\n');

Error in ==> tfbs_scanner_zscore at 8
S = fastaread(fin);

有什么想法吗？

Answer 1

您尝试读取的文件包含的行长于TEXTREAD函数中使用的默认缓冲区大小。

尝试增加缓冲区大小：

ftext = textread(filename, '%s', 'delimiter','\n', 'bufsize',50000);

选择适合您的价值

顺便说一句，TEXTREAD现已过时，考虑升级到TEXTSCAN

matlab：struct buffer size大于4096？

1 个答案: