如何分析~13GB的数据?

时间:2012-07-12 10:32:46

标签: java database matlab large-data

我有大约300个文本文件,其中包含跟踪器,种子和同伴的数据。每个文件的组织方式如下:

tracker.txt

time torrent
    time peer
    time peer
    ...
time torrent
...

每个跟踪器都有几个文件,大部分信息都会重复(相同的信息,不同的时间)。

我希望能够分析我所拥有的内容并报告

之类的统计数据
  • 每个跟踪器有多少种子
  • 上列出了多少种跟踪器
  • 洪流有多少同伴
  • 同伴有多少种子

大量的数据让我很难接受。这是我尝试过的。

的MySQL

我将所有内容都放入数据库中;每个实体类型一个表和用于保存关系的表(例如,此torrent位于此跟踪器上)。

将信息添加到数据库的速度很慢(当我尝试这个时,我没有13GB的信息),但之后分析这些关系是不行的。每个稍微复杂的查询都需要24小时才能完成(如果有的话)。

示例查询将是:

SELECT COUNT(DISTINCT torrent) 
    FROM TorrentAtPeer, Peer 
    WHERE TorrentAtPeer.peer = Peer.id 
    GROUP BY Peer.ip;

我尝试在我的my.cnf文件中增加内存分配,但似乎没有帮助。我使用了my-innodb-heavy-4G.cnf设置文件。

编辑:添加表格详细信息

这是我正在使用的:

Peer         Torrent                  Tracker        
-----------  -----------------------  ------------------  
id (bigint)  id (bigint)              id (bigint)
ip* (int)    infohash* (varchar(40))  url (varchar(255))
port (int)

TorrentAtPeer      TorrentAtTracker
-----------------  ----------------
id (bigint)        id (bigint)
torrent* (bigint)  torrent* (bigint)
peer* (bigint)     tracker* (bigint)
time (int)         time (int)

*indexed field. Navicat reports them as being of normal type and Btree method.
id - Always the primary key

没有外键。我有信心只能使用与现有实体相对应的ID,添加外键检查似乎是一种不必要的延迟。这是天真的吗?

Matlab的

这看起来像是为一些繁重的工作而设计的应用程序,但是我无法分配足够的内存来一次性保存所有数据。

我没有数字数据所以我使用的是单元格数组,我从这些数据移动到尝试以减少占用空间。我无法让它发挥作用。

爪哇

迄今为止我最成功的尝试。我发现Limewire的人们提供了Patricia Tries的实现。使用这个我能够读入数据并计算我有多少独特的实体:

  • 13个跟踪器
  • 1.7mil种子
  • 32mil同行

我仍然觉得很难弄清楚同龄人的种子数量。我试图通过构建这样的尝试来实现这一目标:

Trie<String, Trie<String, Object>> peers = new Trie<String, Trie<String, Object>>(...);
for (String line : file) {
    if (containsTorrent(line)) {
        infohash = getInfohash(line);
    }
    else if (containsPeer(line)) {
        Trie<String, Object> torrents = peers.get(getPeer(line));
        torrents.put(infohash, null);
    }
}

从我迄今为止所能做到的,如果我能够建立peers trie,那么我可以很容易地找出每个同伴有多少种子。我昨天运行了所有内容,当我回来时,我注意到日志文件没有被写入,我^Z应用程序和time报告了以下内容:

real 565m41.479s
user 0m0.001s
sys  0m0.019s

如果用户和系统如此之低,这对我来说不合适?我应该提一下,我还将JVM的堆大小增加到7GB(最大值和启动量),没有这样我很快就会出现内存不足错误。

我不介意等待几个小时/天,但看起来这件事在大约10个小时后就停止了。

我想我的问题是,我该如何分析这些数据呢?我尝试过的东西是正确的吗?有什么我想念的吗?到目前为止,Java解决方案似乎是最好的,有什么办法可以让它工作吗?

4 个答案:

答案 0 :(得分:6)

您声明您的MySQL查询花了太长时间。您是否确保有适当的索引来支持您提交的请求?在您的示例中,这将是Peer.ip(甚至是嵌套索引(Peer.ip,Peer.id))的索引和TorrentAtPeer.peer的索引。

据我了解Java结果,你有很多数据,但没有那么多不同的字符串。所以你可以通过为每个跟踪器,torrent和peer分配一个唯一的号码来节省一些时间。每个表使用一个表,其中一些索引值保存字符串,数字主键作为id。这样,与这些实体相关的所有表格只需要处理这些数字,这可以节省大量空间并使您的操作更快。

答案 1 :(得分:5)

我会给MySQL另一个尝试,但使用不同的架构:

  • 此处不使用id-columns
  • 在这里使用自然主键:

    同行:ip,端口
    Torrent :infohash
    跟踪器:网址 TorrentPeer :peer_ip,torrent_infohash,peer_port,时间
    TorrentTracker :tracker_url,torrent_infohash,time

  • 对所有表使用innoDB引擎

这有几个好处:

  • InnoDB使用聚簇索引作为主键。意味着当您仅从主键列请求数据时,可以直接从索引检索所有数据而无需额外查找。所以InnoDB表是一些索引组织的表。
  • 较小的尺寸,因为您不必存储代理键。 - &GT;速度,因为相同结果的IO较小。
  • 您可以在不使用(昂贵)连接的情况下立即执行某些查询,因为您使用自然的主键和外键。例如,链接表TorrentAtPeer直接包含peer ip作为对等表的外键。如果您需要查询子网中对等体使用的种子,您现在可以在不使用连接的情况下执行此操作,因为所有相关数据都在链接表中。

如果你想要每个对等体的种子数量,并且你想要结果中的对等体ip,那么我们在这里使用自然主/外键时再次具有优势。

使用您的架构,您必须加入以检索IP:

SELECT Peer.ip, COUNT(DISTINCT torrent) 
    FROM TorrentAtPeer, Peer 
    WHERE TorrentAtPeer.peer = Peer.id 
    GROUP BY Peer.ip;

使用自然的主键/外键:

SELECT peer_ip, COUNT(DISTINCT torrent) 
    FROM TorrentAtPeer 
    GROUP BY peer_ip;

修改 好吧,原始发布的架构不是真正的架构。现在Peer表格有一个port字段。我建议在这里使用主键(ip,port)并仍然删除id列。这也意味着链接表需要具有多列外键。调整答案......

答案 2 :(得分:0)

如果你可以使用C ++,你应该看看Boost flyweight

使用flyweight,您可以像编写字符串一样编写代码,但字符串的每个实例(您的跟踪器名称等)仅使用指针的大小。

无论语言如何,您都应该将IP地址转换为int(请查看this question)以节省更多内存。

答案 3 :(得分:0)

您很可能遇到可以通过NOSQL和分布式技术解决的问题。

i)我会使用Hadoop / HBase编写分布式系统。

ii)租用几十台/百台AWS机器,但仅持续几秒钟(它仍然会花费不到0.50美元)

iii)利润!!!