Question

可能重复：
R suppress startupMessages from dependency

我读过关于使用sink("NUL") / sink("/dev/null")的内容，但他们都没有解决我遇到的问题。即使我将library()命令包含在sink("NUL")和sink()中，我对Rscript的调用也会输出我不想看到的所有信息：

Loading required package: Matrix
Loading required package: methods
Loading required package: lattice
Loaded glmnet 1.8

Loading required package: MASS
Loading required package: lme4

Attaching package: 'lme4'

The following object(s) are masked from 'package:stats':

    AIC, BIC

Loading required package: R2WinBUGS
Loading required package: coda

Attaching package: 'coda'

The following object(s) are masked from 'package:lme4':

    HPDinterval

Loading required package: abind
Loading required package: foreign

arm (Version 1.5-05, built: 2012-6-6)

Working directory is C:/Users/andrews/bootstraps/user/_branches/ER-PoC/Bootstraps/R


Attaching package: 'arm'

The following object(s) are masked from 'package:coda':

    traceplot

[1] "client=51"         "date='01-01-2011'"
[1] "01-01-2011"
[1] 51

最后的东西是我真正想要的唯一输出，也是我似乎能用sink()命令抑制的唯一输出。看起来似乎应该只有一个Rscript的参数来抑制这个输出（如果我在控制台中source我的脚本，它甚至不显示... ...任何输入？

Answer 1

安德鲁，我遇到了同样的事情而且suppressMessages()没有删除所有额外的输出，但使用sink()形式的capture.output()缠绕suppressMessages()的工作原理。

$ rscript --vanilla -e 'library(Rmpfr)'
Loading required package: methods
Loading required package: gmp
---->8----
Loading C code of R package 'Rmpfr': GMP using 32 bits per limb
---->8----


$ rscript --vanilla -e 'suppressMessages( library(Rmpfr) )'
Loading C code of R package 'Rmpfr': GMP using 32 bits per limb


$ rscript --vanilla -e 'msg.out <- capture.output( suppressMessages( library(Rmpfr) ) )'

加载Rmpfr软件包时发生的事情是使用message连接编写的几个表现良好的启动消息以及使用output连接的不太好的消息。当然，您可以自己创建和操作sink()，但这就是capture.output()已经设置的目的。

也许设置一个详细的arg以获得更多控制权将是有帮助的::

$ cat sample.R
#!/c/opt/R/R-2.15.0/bin/rscript --vanilla

cmd_args <- commandArgs( TRUE );

if( length( cmd_args ) > 0 ) {
  eval( parse( text = cmd_args[1] ) )
}

if( exists( "verbose" ) ) {
  library( Rmpfr )
} else {
  msg.trap <- capture.output( suppressMessages( library( Rmpfr ) ) )
}

print("Hello")

产生::

$ ./sample.R
[1] "Hello"


$ ./sample.R "verbose=TRUE"
Loading required package: methods
Loading required package: gmp

Attaching package: 'gmp'
---->8----
[1] "Hello"

你可以在那里玩很多东西，但至少你可以看到如何完全抑制msg输出。

希望它有所帮助。玩得开心！

使用Rscript，是否有一种很好的方法来抑制非脚本输出？

1 个答案: