Question

另一个问题！我有成对的核苷酸数据

1 Affx-14150122 0 75891 00 CT TT CT TT CT

按空格分割，我需要在每对中加一个空格，例如

1 Affx-14150122 0 75891 0 0 C T T T C T T T C T

我已尝试sed 's/[A-Z][A-Z]/ &/g'和sed 's/[A-Z][A-Z]/& /g'

并且A-Z都替换为..并且它永远不会按照我的意愿拆分它（它在前后放置空格或者拆分每对其他对或类似的！）。

Answer 1

我认为这对你有用，但并不完美！

echo "1 Affx-14150122 0 75891 00 CT TT CT TT CT" | \
  sed 's/\(\s[A-Z]\)\([A-Z]\)/\1 \2/g'

给出

1 Affx-14150122 0 75891 00 C T T T C T T T C T

sed 's/\(\s[A-Z]\)\([A-Z]\)/\1 \2/g'匹配空格（\s）大写字符（[A-Z]），将其放在一个组（\(...\)）中，然后匹配大写字符并存储在第二组。然后，此匹配由第一组（\1）空格第二组（\2）替换。

注意：
如果序列长度超过2个字符，则会失败。

Answer 2

使用awk的解决方案，它只修改字符对，并且可能更强大，具体取决于您的输入数据：

echo "1 Affx-14150122 0 75891 00 CT TT CT TT CT" | \
  awk '
    {
      for(i=1;i<=NF;i++) {
        if($i ~ /^[A-Z][A-Z]$/){ 
          $i=substr($i,1,1)" "substr($i,2,1)
        }
       }
     }
     1'

给出

1 Affx-14150122 0 75891 00 C T T T C T T T C T1

Answer 3

这可能适合你（GNU sed）：

echo '1 Affx-14150122 0 75891 00 CT TT CT TT CT' | 
sed ':a;s/\(\s\S\)\(\S\(\s\|$\)\)/\1 \2/g;ta'
1 Affx-14150122 0 75891 0 0 C T T T C T T T C T

第二种方法有效，但可能会出现误报：

echo '1 Affx-14150122 0 75891 00 CT TT CT TT CT' | sed 's/\<\(.\)\(.\)\>/\1 \2/g'
1 Affx-14150122 0 75891 0 0 C T T T C T T T C T

Answer 4

这在python中实际上比在awk中更容易：

echo caca | python -c 'import sys;\
for line in sys.stdin: print (" ".join(line))'

c a c a

在字符对之间插入空格 - sed

4 个答案: