为什么我的并行代码比顺序代码慢?

时间:2012-09-16 06:16:58

标签: c optimization parallel-processing openmp mergesort

我在C中实现了一个并行代码,用于使用OPENMP进行合并排序。我的速度提高了3.9秒,这比相同代码的顺序版本慢得多(我得到的是3.6)。我试图将代码优化到最佳状态但不能提高加速。你能帮忙解决这个问题吗?感谢。

 void partition(int arr[],int arr1[],int low,int high,int thread_count)
 {
int tid,mid;

#pragma omp if
if(low<high)
{
    if(thread_count==1)
    {
            mid=(low+high)/2;
            partition(arr,arr1,low,mid,thread_count);
            partition(arr,arr1,mid+1,high,thread_count);
                sort(arr,arr1,low,mid,high);
    }
    else
    {
        #pragma omp parallel num_threads(thread_count) 
        {
                mid=(low+high)/2;
                #pragma omp parallel sections  
                {
                    #pragma omp section
                    {
                        partition(arr,arr1,low,mid,thread_count/2);
                        }
                    #pragma omp section
                    {   
                        partition(arr,arr1,mid+1,high,thread_count/2);
                    }
                }
        }
        sort(arr,arr1,low,mid,high);

    }
}
 }

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

正如您所正确指出的那样,您的代码中存在多个错误会阻止其正确执行,因此我建议您首先检查这些错误。

无论如何,只考虑OpenMP性能如何与线程一起扩展,也许基于任务指令的实现更适合,因为它克服了先前答案已经指出的限制:

  

由于sections指令只有两个部分,我认为你不会从并行子句中产生比两个更多的线程获得任何好处

您可以在下面找到此类实施的痕迹:

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <assert.h>
#include <sys/time.h>

void getTime(double *t) {

  struct timeval tv;

  gettimeofday(&tv, 0);
  *t = tv.tv_sec + (tv.tv_usec * 1e-6);
}

int compare( const void * pa, const void * pb ) {

  const int a = *((const int*) pa);
  const int b = *((const int*) pb);

  return (a-b);
}

void merge(int * array, int * workspace, int low, int mid, int high) {

  int i = low;
  int j = mid + 1;
  int l = low;

  while( (l <= mid) && (j <= high) ) {
    if( array[l] <= array[j] ) {
      workspace[i] = array[l];
      l++;
    } else {
      workspace[i] = array[j];
      j++;
    }
    i++;
  }
  if (l > mid) {
    for(int k=j; k <= high; k++) {
      workspace[i]=array[k];
      i++;
    }
  } else {
    for(int k=l; k <= mid; k++) {
      workspace[i]=array[k];
      i++;
    }
  }
  for(int k=low; k <= high; k++) {
    array[k] = workspace[k];
  }
}

void mergesort_impl(int array[],int workspace[],int low,int high) {

  const int threshold = 1000000;

  if( high - low > threshold  ) {
    int mid = (low+high)/2;
    /* Recursively sort on halves */
#ifdef _OPENMP
#pragma omp task 
#endif
    mergesort_impl(array,workspace,low,mid);
#ifdef _OPENMP
#pragma omp task
#endif
    mergesort_impl(array,workspace,mid+1,high);
#ifdef _OPENMP
#pragma omp taskwait
#endif
    /* Merge the two sorted halves */
#ifdef _OPENMP
#pragma omp task
#endif
    merge(array,workspace,low,mid,high);
#ifdef _OPENMP
#pragma omp taskwait
#endif
  } else if (high - low > 0) {
    /* Coarsen the base case */
    qsort(&array[low],high-low+1,sizeof(int),compare);
  }

}

void mergesort(int array[],int workspace[],int low,int high) {
  #ifdef _OPENMP
  #pragma omp parallel
  #endif
  {
#ifdef _OPENMP
#pragma omp single nowait
#endif
    mergesort_impl(array,workspace,low,high);
  }
}

const size_t largest = 100000000;
const size_t length  = 10000000;

int main(int argc, char *argv[]) {

  int * array = NULL;
  int * workspace = NULL;

  double start,end;

  printf("Largest random number generated: %d \n",RAND_MAX);
  printf("Largest random number after truncation: %d \n",largest);
  printf("Array size: %d \n",length);
  /* Allocate and initialize random vector */
  array     = (int*) malloc(length*sizeof(int));
  workspace = (int*) malloc(length*sizeof(int));
  for( int ii = 0; ii < length; ii++)
    array[ii] = rand()%largest;
  /* Sort */  
  getTime(&start);
  mergesort(array,workspace,0,length-1);
  getTime(&end);
  printf("Elapsed time sorting: %g sec.\n", end-start);
  /* Check result */
  for( int ii = 1; ii < length; ii++) {
    if( array[ii] < array[ii-1] ) printf("Error:\n%d %d\n%d %d\n",ii-1,array[ii-1],ii,array[ii]);
  }
  free(array);
  free(workspace);
  return 0;
}

请注意,如果您寻求性能,您还必须保证递归的基本情况足够粗,以避免由于递归函数调用而产生大量开销。除此之外,我建议您对代码进行分析,以便您可以很好地了解哪些部分值得优化。

答案 1 :(得分:2)

花了一些时间来搞清楚,这有点令人尴尬,因为当你看到它时,答案就是这么简单。

正如问题所在,程序无法正常运行,而是在某些运行中随机复制某些数字并丢失其他数字。这似乎是一个完全并行的错误,在使用变量thread_count == 1运行程序时不会出现。

pragma“parallel sections”是一个组合的parallel和sections指令,在这种情况下意味着它在前一个内部开始第二个并行区域。其他并行区域内的并行区域很好,但我认为大多数实现在遇到嵌套并行区域时不会给你额外的线程。

修复是替换

 #pragma omp parallel sections

 #pragma omp sections

在此修复之后,程序开始给出正确的答案,并且使用两个核心系统,对于一百万个数字,我得到以下结果的计时。

一个主题:

time taken: 0.378794

两个主题:

time taken: 0.203178

由于sections指令只有两个部分,我认为你不会从并行子句中产生比两个更多的线程获得任何好处,所以更改num_threads(thread_count) - &gt; NUM_THREADS(2)

但是由于至少我尝试过的两个实现无法为嵌套的并行区域生成新线程,所以程序不能扩展到两个以上的线程。