CRAN封装取决于Bioconductor封装安装错误

时间:2013-01-15 17:56:09

标签: r cran bioconductor

我管理了Depends,建议和导入描述文件。最后我将我的包裹提交给CRAN。但是在安装软件包时,它只会安装CRAN下不存在bioconductor软件包的软件包。此外,它还具有Mac OS的程序包依赖性错误: check log for Mac OS

可能是什么问题?我怎么能修好它?

亲切的问候,

2 个答案:

答案 0 :(得分:11)

在R 3.0.2中,以下工作:

setRepositories(ind=1:2)

在撰写本文时,值ind可以采用值介于1和8之间的向量,其含义如下:

1:   CRAN
2:   BioC software
3:   BioC annotation
4:   BioC experiment
5:   BioC extra
6:   Omegahat
7:   R-Forge
8:   rforge.net

此列表是通过调用setRepositories(graphics=F)获得的,该列表还允许以交互方式选择要安装的存储库。

答案 1 :(得分:9)

这在任何地方都没有记录,但诀窍是你在biocViews:文件中添加了一行DESCRIPTION(是的,它以冒号结尾,然后无需列出任何内容,你可以保持空白)。然后R将知道检查bioconductor存储库的包装要求。