Question

我目前正在尝试在计算群集上运行一些R代码，但由于我的群集上有一些奇怪的防火墙设置，因此无法运行install.packages功能。由于我只在R代码中使用了一些软件包，因此我希望通过手动下载和安装软件包来避免使用install.packages函数。

注意：我知道有一种方法可以通过使用R FAQ中描述的HTTP代理来避免此问题。不幸的是，负责我的集群的人没有帮助设置它，所以我不得不考虑这种替代方法。

理想情况下，我想将软件包从CRAN下载到我的计算机，然后将这些文件上传到集群并使用R中的相应命令安装它们。此外，我还要确保软件包是安装到我选择的位置，因为我没有在默认R目录中“写”的权限（我相信我可以使用.libPaths函数在R中执行此操作）

最后，我在群集上使用的计算机是Unix x86_64。

Answer 1

您可以使用以下命令手动安装软件包

install.packages('package.zip', lib='destination_directory',repos = NULL)

有关详细说明，请参阅?install.packages的帮助

Answer 2

这是更好的方法，如果我们想在本地下载和安装：

download.packages('lib_name',destdir='dest_path')

例如：

download.packages('RJDBC',destdir='d:/rlibs')

Answer 3

install.packages（“libname”，lib =“file：// F：/ test”）

Answer 4

在安装插入符号包时，我也遇到了同样的问题，插入符号包有很多依赖性。所以，我做了以下

install.packages（'插入符'）这将使所有zip格式的软件包的下载位置显示在错误消息中。将所有软件包从下载源解压缩到某个位置，例如在'C：/ PublicData / RawRPackages'中，然后运行以下命令。

foldername<-'C:/PublicData/RawRPackages'
install.packages(paste(foldername , 'caret',sep='/'), repos = NULL, type="source")
library(caret, lib.loc=foldername)

在R中手动下载和安装软件包

4 个答案: