我有两个数据集，一个是log10转换而另一个是RMA规范化。
dim(protdata) [1] 437 7
Locus COBL9 WER CORTEX SCR WOL PET111
1 AT1G01090 4.3035 4.3975 4.4620 4.3879 4.2620 4.2045
2 AT1G02780 4.7852 4.6865 4.7801 5.0038 4.9457 4.9515
3 AT1G04040 4.5854 4.1787 3.4836 3.4918 4.2366 3.5197
4 AT1G04270 4.3578 4.4281 4.3348 4.5680 4.4208 4.4056
5 AT1G04410 4.9808 4.9913 5.2186 5.3315 5.2178 5.4524
6 AT1G04430 4.2382 4.3564 4.3535 4.3056 4.0263 3.9485
7 AT1G04480 4.5462 4.4302 4.4987 4.8039 4.5807 4.4876
dim(transdata) [1] 22810 77
Locus probes COBL9 WER CORTEX SCR
1 AT1G01090 244901_at 4.7852 4.6865 4.7801 5.0038
2 AT1G02780 244902_at 4.5854 4.1787 3.4836 3.4918
3 AT1G04040 244903_at 4.3578 4.4281 4.3348 4.5680
4 AT1G04570 244904_at 4.9808 4.9913 5.2186 5.3315
5 AT1G04610 244905_at 4.2382 4.3564 4.3535 4.3056
6 AT1G02430 244906_at 4.5462 4.4302 4.4987 4.8039
我想根据Locus ID合并两个数据帧并使用
matchin<-merge(transdata,protdata,by.x="Locus",by.y="Locus")
但是我得到了一个不同的数据帧，如下所示：在上面的例子中，我在两个帧中都有两个匹配的ID，但结果是：
Locus probes COBL9 WER CORTEX SCR
1 AT1G01090 244901_at 14.7852 12.6865 13.7801 12.0038
2 AT1G02780 244902_at 14.5854 13.1787 12.4836 13.4918
COBL9 WER CORTEX SCR WOL PET111
4.3035 4.3975 4.4620 4.3879 4.2620 4.2045
4.7852 4.6865 4.7801 5.0038 4.9457 4.9515
虽然它是一个包含唯一轨迹id的数据帧，但仅来自transdata的强度值已发生变化。
答案 0 :(得分：1)
适合我。清除工作区并开始新的工作区。确保使用正确的物体。
> merge(transdata,protdata, by = "Locus")
Locus probes COBL9.x WER.x CORTEX.x SCR.x COBL9.y WER.y CORTEX.y SCR.y WOL PET111
1 AT1G01090 244901_at 4.7852 4.6865 4.7801 5.0038 4.3035 4.3975 4.4620 4.3879 4.2620 4.2045
2 AT1G02780 244902_at 4.5854 4.1787 3.4836 3.4918 4.7852 4.6865 4.7801 5.0038 4.9457 4.9515
3 AT1G04040 244903_at 4.3578 4.4281 4.3348 4.5680 4.5854 4.1787 3.4836 3.4918 4.2366 3.5197