使用PostgreSQL COPY时出现“错误:上一个预期列之后的额外数据”

时间:2013-05-03 20:56:25

标签: postgresql database-design dynamic-sql sqlbulkcopy

请耐心等待,因为这是我的第一篇文章。

我正在尝试在PostgreSQL-9.2中运行COPY命令,将.txt文件中的制表符分隔表添加到PostgreSQL数据库,例如:

COPY raw_data FROM '/home/Projects/TestData/raw_data.txt' WITH (DELIMITER ' ');

我已经使用SQL命令在数据库中创建了一个名为“raw_data”的空表:

CREATE TABLE raw_data ();

尝试运行COPY命令时,我一直收到以下错误消息:

ERROR:  extra data after last expected column
CONTEXT:  COPY raw_data, line 1: "  1   2   3   4   5   6   7   8   9   10  11  12  13  14  15  16  17  18  19  20  21  22  23  24  25  26  27  28  29  30  31  32  33  34  35  36  ..."

(这里的数字应该是列标题)

我不确定是否因为我在创建db表时没有指定表列,但我试图避免手动输入800或列。

有关如何解决此问题的任何建议吗?

以下是.txt文件的示例:

        1   2   3   4   5   6   7   8   9
binary1 1   1   0   1   1   1   1   1   1
binary2 1   0   0   1   0   1   1   0   0
binary3 1   0   1   1   1   0   0   1   0
binary4 1   1   1   1   0   1   0   1   0

2 个答案:

答案 0 :(得分:11)

空表不行。您需要与输入数据结构匹配的表。类似的东西:

CREATE TABLE raw_data (
  col1 int
, col2 int
  ...
);

您无需将tab声明为DELIMITER,因为这是默认设置:

COPY raw_data FROM '/home/Projects/TestData/raw_data.txt';
你说的800列吗?许多列通常表明您的设计存在问题。无论如何,有一些方法可以使CREATE TABLE脚本自动化一半。

自动化

假设简化原始数据

1   2   3   4  -- first row contains "column names"
1   1   0   1  -- tab separated
1   0   0   1
1   0   1   1

定义不同的DELIMITER(根本不会出现在导入数据中),并导入到具有单个text列的临时登台表:

CREATE TEMP TABLE tmp_data (raw text);

COPY tmp_data FROM '/home/Projects/TestData/raw_data.txt' WITH (DELIMITER '§');

此查询创建CREATE TABLE脚本:

SELECT 'CREATE TABLE tbl (col' || replace (raw, E'\t', ' bool, col') || ' bool)'
FROM   (SELECT raw FROM tmp_data LIMIT 1) t;

更通用的&更安全的查询:

SELECT 'CREATE TABLE tbl('
    ||  string_agg(quote_ident('col' || col), ' bool, ' ORDER  BY ord)
    || ' bool);'
FROM  (SELECT raw FROM tmp_data LIMIT 1) t
     , unnest(string_to_array(t.raw, E'\t')) WITH ORDINALITY c(col, ord);

返回:

CREATE TABLE tbl (col1 bool, col2 bool, col3 bool, col4 bool);

验证有效性后执行 - 如果您信任结果,则动态执行:

DO
$$BEGIN
EXECUTE (
   SELECT 'CREATE TABLE tbl (col' || replace(raw, ' ', ' bool, col') || ' bool)'
   FROM  (SELECT raw FROM tmp_data LIMIT 1) t
   );
END$$;

然后使用此查询INSERT数据:

INSERT INTO tbl
SELECT (('(' || replace(replace(replace(
                  raw
                , '1',   't')
                , '0',   'f')
                , E'\t', ',')
             || ')')::tbl).*
FROM   (SELECT raw FROM tmp_data OFFSET 1) t;

使用translate()更简单:

INSERT INTO tbl
SELECT (('(' || translate(raw, E'10\t', 'tf,') || ')')::tbl).*
FROM   (SELECT raw FROM tmp_data OFFSET 1) t;

将字符串转换为行文字,转换为新创建的表格行类型并使用(row).*进行分解。

全部完成。

您可以将所有这些放入plpgsql函数中,但是您需要防止SQL注入。 (这里有很多相关的解决方案。请尝试搜索。

db<>小提琴here
Old SQL Fiddle

答案 1 :(得分:1)

您可以直接从copy命令创建表,查看COPY中的HEADER选项,如: 复制来自'/path/to/csv/SourceCSVFile.csv'DELIMITERS','CSV HEADER

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