如何从cgi脚本获取python os.environ参数?

时间:2013-05-16 13:21:55

标签: python cgi environment-variables rdkit

当我使用

os.environ.keys()

在命令行中我得到的环境变量与cgi脚本不同。有没有办法通过cgi脚本获取python环境变量?

使用

subprocess.Popen

我没有得到相同的参数。

你能帮我吗?

编辑:

例如,在命令行中,我的环境参数是

['rvm_version', 'rvm_path', 'LESSOPEN', 'escape_flag', 'SSH_CLIENT', 
'LOGNAME', 'USER', 'HOME', 'PATH', 'RDBASE', 'LD_LIBRARY_PATH', 'LANG',           
'TERM', 'SHELL', '_first', 'SHLVL', '__array_start', 'G_BROKEN_FILENAMES', 
'HISTSIZE', 'LISISTOOLS_PATH', 'GEM_PATH', 'rvm_bin_path', 'rvm_prefix', 
'PYTHONPATH', 'IRBRC', 'AUTODOCK_PATH', 'MY_RUBY_HOME', 'BOOST', '_', 
 '_second', 'SSH_CONNECTION', 'RUBY_VERSION', 'GRANATUM_LICENSE_FILE',      
 'OLDPWD', 'HOSTNAME', 'HISTCONTROL', 'PWD', 'SSH_TTY', 'MAIL', 'LS_COLORS', 
 'GEM_HOME', 'MGLTOOLS']

但是我的cgi脚本是:

['HTTP_COOKIE', 'SERVER_SOFTWARE', 'SCRIPT_NAME', 'SERVER_SIGNATURE', 
'REQUEST_METHOD', 'SERVER_PROTOCOL', 'QUERY_STRING', 'PATH', 'DUMP_FILE', 
'HTTP_ACCEPT_CHARSET', 'HTTP_USER_AGENT', 'HTTP_CONNECTION', 'HTTP_REFERER', 
'SERVER_NAME', 'REMOTE_ADDR', 'SERVER_PORT', 'SERVER_ADDR', 'DOCUMENT_ROOT', 
'SCRIPT_FILENAME', 'SERVER_ADMIN', 'HTTP_HOST', 'REQUEST_URI', 'HTTP_ACCEPT',         
'GATEWAY_INTERFACE', 'REMOTE_PORT', 'HTTP_ACCEPT_LANGUAGE',     
'HTTP_ACCEPT_ENCODING']

我想要第一组环境变量(命令行)到cgi-script。

我在cgi脚本中导入时

from rdkit import Chem

我收到错误

 /home/galaxy/working/RDKit/rdkit/Chem/__init__.py in ()
16  
17 """
18 from rdkit import rdBase
<type 'exceptions.ImportError'>: libRDGeneral.so.1: cannot open shared object 
file: No such file or directory 
  args = ('libRDGeneral.so.1: cannot open shared object file: No such file or 
         directory',) 
  message = 'libRDGeneral.so.1: cannot open shared object file: No such file 
         or directory'

但在命令行中我没有错误。

PYTHONPATH 包含

'/家/星系/工作:/家庭/星系/工作/ RDKit:/home/galaxy/working/mgltools_x86_64Linux2_1.5.4/MGLToolsPckgs:/home/galaxy/working/mgltools_x86_64Linux2_1.5.4/MGLToolsPckgs'< / I>

我使用

更新sys.path
 sys.path.append('/home/galaxy/working')
 sys.path.append('/home/galaxy/working/RDKit')
 sys.path.append('/home/galaxy/working/mgltools_x86_64Linux2_1.5.4/
 MGLToolsPckgs')
 sys.path.append('/home/galaxy/working/mgltools_x86_64Linux2_1.5.4/      
 MGLToolsPckgs')

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您误解了这种情况:os.environ只是为您提供了操作系统提供的流程环境的值。您的CGI脚本在Apache下运行,因此当您从命令行运行它时,它具有与同一脚本不同的环境。 (例如,USER必然不同)。

简而言之,你所要求的并不存在。你 获取python环境变量,它们不是你所期望的。请解释您正在尝试完成的内容,即为什么您正试图获取这些环境值。我可以告诉你如何设置你的CGI脚本,使其环境与你的命令行环境相匹配,但是谁知道你的需要是什么?

修改:所以你的目标是导入一个模块。您可以通过将目录附加到sys.path(列表)来动态更改模块导入路径。尝试明确添加rdkit的位置。你不需要环境。

答案 1 :(得分:0)

我认为你可以做到

subprocess.Popen([cmd],env={'my':'environment','vars':4, ...})

并强制执行一组特定的环境变量