R不再并行运行

Question

我运行（k）Ubuntu 12.04.2和R 3.0.1

我写了一堆曾经并行运行的代码，但现在它已经不再存在了。甚至不再是并行运行：

library(doMC)
registerDoMC(4)
Results = foreach (i = 1:1e6, .combine = "c") %dopar% {
  sqrt(i)
}

这绝对应该。我认为打破了它是R 3.0.1更新或我安装的-dev, -devel BLAS包。 （我觉得openBLAS）

我按照其他地方的建议尝试了system(sprintf("taskset -p 0xffffffff %d", Sys.getpid()))，并得到了这个结果：

pid 2415's current affinity mask: 1
pid 2415's new affinity mask: f

我也尝试过用R运行：

taskset 0xffff R

然而，在执行这些循环之后，仍然只使用一个核心。

我想要并行处理！我怎么能得到它？

Answer 1

我找到了解决方案！具有讽刺意味的是，为了得到并行处理，我必须同时执行我在Q 中提到的两个步骤

所以，用

开始R.

taskset 0xffff R

然后运行

system(sprintf("taskset -p 0xffffffff %d", Sys.getpid()))

在R.内。

Voila，并行处理返回