在Android项目中包含插件作为二进制文件和源文件？

Question

我有很多插件（和开源库）可以包含在Android应用中。假设我手头有二进制文件和源文件，我应该选择以下哪个选项来保持项目的清洁，快速，以及性能和维护为导向？

1. 在PROJECT_ROOT/bin/
下包含插件/库作为二进制文件
2. 在PROJECT_ROOT/MY_PLUGIN_NAME/或PROJECT_ROOT/src/com.mypluginname/
下包含插件/库作为源文件

选择一个选项比另一个选项有什么缺点？