格式化persp3d图

时间:2013-06-23 08:05:01

标签: r colors plot

我有以下三维图:

ro

使用我的data,我使用以下代码创建了它:

library(rugarch)
library(rgl)
library(fGarch)

fd <- as.data.frame(modelfit, which = 'density')
color <- rgb(85, 141, 85, maxColorValue=255)

x <- seq(-0.2, 0.2, length=100)
y <-c(1:2318)

f <- function(s, t) {
 dged(s,mean=fd[t,'Mu'],sd=fd[t,'Sigma'],nu=fd[t,'Shape'])

}

z <- outer(x, y, f)
persp3d(x, y, z, theta=50, phi=25, expand=0.75, col=color,
      ticktype="detailed", xlab="", ylab="time", zlab="",axes=TRUE)

如何根据z值获得着色?我查看了不同的解决方案,例如这个one,但在这种情况下我无法根据z值创建着色。 根据{{​​3}}的解决方案如下:

nrz <- nrow(z)
ncz <- ncol(z)
jet.colors <- colorRampPalette( c("#ffcccc", "#cc0000") ) 
# Generate the desired number of colors from this palette
nbcol <- 100
color <- jet.colors(nbcol)

# Compute the z-value at the facet centres
zfacet <- z[-1, -1] + z[-1, -ncz] + z[-nrz, -1] + z[-nrz, -ncz]
# Recode facet z-values into color indices
facetcol <- cut(zfacet, nbcol)

  persp3d(x, y, z, theta=50, phi=25, expand=0.75, col=color[facetcol],
          ticktype="detailed", xlab="", ylab="time", zlab="",axes=TRUE)

但这并没有给出好的结果,因为它没有给适当的情节着色。我希望我的表面有尖峰,例如红色和低值例如蓝色有一个很好的平滑过渡,但这种颜色的切片,所以取决于时间?所以极端大的尖峰应该用红色的尖峰着色,底部的值应该是彩色的。在绿色。我怎么能得到这个?

编辑:我找到了我之前关于轴上日期的问题的解决方案,唯一的问题是依赖于z值的适当着色。

3 个答案:

答案 0 :(得分:22)

试试这个:

nbcol = 100
color = rev(rainbow(nbcol, start = 0/6, end = 4/6))
zcol  = cut(z, nbcol)
persp3d(x, y, z, theta=50, phi=25, expand=0.75, col=color[zcol],
        ticktype="detailed", xlab="", ylab="time", zlab="",axes=TRUE)

theplot

如果您希望着色是时间(因此尖峰总是红色),您可以为每个时间片设置着色:

mycut = function(x, breaks) as.numeric(cut(x=x, breaks=breaks)) # to combine different factors
zcol2 = as.numeric(apply(z,2, mycut, breaks=nbcol)) 
persp3d(x, y, z, theta=50, phi=25, expand=0.75, col=color[zcol2],
        ticktype="detailed", xlab="", ylab="time", zlab="",axes=TRUE)

theplot2

您已经知道如何正确编辑轴。

答案 1 :(得分:6)

要断言对轴的控制,您需要在axes=FALSE来电中设置persp3d(正如您昨天所说),然后使用axes3daxis3d具有您选择的参数的函数。要指定沿yz-box下段显示值的x轴,请使用edge= 'x--'。要使用rownames标记y轴,请使用'labels'和'at'参数:

plot3d ( ..., axes=FALSE, ...)
# repositions x axis and draws default z axis
axes3d(c('x--','z'))  
# Use custom labels
axis3d(edge= 'y+-', at =seq(500,2000,by=500), 
                    labels = rownames(fd)[seq(500,2000,by=500)] )

enter image description here

(注意:要正确地玩这个SO游戏,你需要给予提供帮助的其他人。这与a question from yesterday没什么不同,我看不到对那里有用贡献的积极回应。我我想知道人们是否变得不感兴趣。)

答案 2 :(得分:4)

以下是根据z值回答关于表面着色的问题的解决方案。我们的想法是根据表面(相对)高度为表面的每个点指定一种颜色。 下面的代码包括@DWin提出的轴定制。

library(rugarch)
library(rgl)
library(fGarch)

fd <- as.data.frame(modelfit, which = 'density')
x  <- seq(-0.2, 0.2, length=100)
y  <- c(1:2318)

f <- function(s, t) {
    dged(s,mean=fd[t,'Mu'],sd=fd[t,'Sigma'],nu=fd[t,'Shape'])
}

z <- outer(x, y, f)

## Color definition of each point of the surface
height <- (z - range(z)[1]) / diff(range(z))
r.prop <- height
g.prop <- 0
b.prop <- 1 - height
color  <- rgb(r.prop, g.prop, b.prop, maxColorValue=1)

persp3d(x, y, z, theta=50, phi=25, expand=0.75, col=color,
        ticktype="detailed", xlab="", ylab="time", zlab="",axes=FALSE)
axes3d(c('x--','z'))  
# Use custom labels
axis3d(edge= 'y+-', at =seq(500,2000,by=500), 
       labels = rownames(fd)[seq(500,2000,by=500)] )

theplot