使用heatmap创建侧边栏

Question

我有一个基因组数据文件，我正在尝试创建数据热图以及染色体信息的侧栏。为了制作热图，我从我的文件转换了数值，以创建一个我能够绘制的数据矩阵：

Heatmap <- heatmap.2(DataMatrix, trace="none", col=greenred, key=T, keysize=1.5, labRow=NA, density.info="none", Colv=FALSE)

但是，我想添加一个额外的颜色侧栏来指示所述数据的染色体位置。特别是我想只有两种颜色，如果它来自任何其他染色体的“chrX”或“黄色”，则说“黑色”。包含此信息的列不在我的数据矩阵中，我不确定如何将此信息包含在我的热图中。任何帮助将不胜感激！

Answer 1

heatmap.2函数有一个RowSideColors参数用于此目的，正如您可能从文档中推断的那样：

  

RowSideColors :(可选）长度为'nrow（x）'的字符向量             包含可能的垂直边栏的颜色名称             用于注释'x'的行。

我最近还在NMF包中发现了aheatmap函数，该函数在热图上制作了具有任意数量的注释行/列的精美热图。在该主页上，您会找到several links到heatmap examples。