伽玛参数的渐变色标?

时间:2013-08-03 20:10:43

标签: r graphics colors gradient

我有一些成像数据具有非常微弱的对比度和相当多的噪音,当我用线性色标显示它时,它显示不好。在像imageJ或photoshop这样的成像软件中,有一个色调曲线可以调整,以非线性的方式突破对比度,并有效地拉伸某些感兴趣区域的比例,以查看更多细节。

作为这种非线性调整参数的最简单情况,@ BrianDiggs指出了bias colorRamp的{​​{1}}参数,它仍然需要先将数据转换为[0,1]。 我想将非线性比例推广到除x^gamma之外的其他函数,因此下面的函数实际上并不使用bias中的colorRamp,而是在数据端进行转换。

我觉得我正在重新发明轮子;在R中是否已经有这样一种连续色标的工具?

1 个答案:

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这是一个可能的解决方案,

set.seed(123)
x <- sort(runif(1e4, min=-20 , max=120))

library(scales) # rescale function

curve_pal <- function (x, colours = rev(blues9), 
                       fun = function(x) x^gamma,
                       n=10, gamma=1) 
{
    # function that maps [0,1] -> colours
    palfun <- colorRamp(colors=colours)

    # now divide the data in n equi-spaced regions, mapped linearly to [0,1]
    xcuts <- cut(x, breaks=seq(min(x), max(x), length=n))
    xnum <- as.numeric(xcuts)

    # need to work around NA values that make colorRamp/rgb choke
    testNA <- is.na(xnum)
    xsanitised <- ifelse(testNA, 0, fun(rescale(xnum))) 

    # non-NA values in [0,1] get assigned their colour
    ifelse(testNA, NA, rgb(palfun(xsanitised), maxColorValue=255))
}

library(gridExtra)
grid.newpage()
grid.arrange(rasterGrob(curve_pal(x, gamma=0.5), wid=1, heig=1, int=F),
             rasterGrob(curve_pal(x, gamma=1), wid=1, heig=1, int=F), 
             rasterGrob(curve_pal(x, gamma=2), wid=1, heig=1, int=F), 
             nrow=1)

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