R + Hadoop:如何从HDFS读取CSV文件并执行mapreduce?

时间:2013-08-07 01:19:16

标签: r hadoop rhadoop

在以下示例中:

  small.ints = to.dfs(1:1000)
  mapreduce(
    input = small.ints, 
    map = function(k, v) cbind(v, v^2))

mapreduce函数的数据输入是一个名为small.ints的对象,它引用了HDFS中的块。

现在我有一个已存储在HDFS中的CSV文件

"hdfs://172.16.1.58:8020/tmp/test_short.csv"

如何获取对象?

据我所知(可能是错误的),如果我想将CSV文件中的数据作为mapreduce的输入,我必须先在R中生成一个包含CSV文件中所有值的表。我确实有这样的方法:

data=from.dfs("hdfs://172.16.1.58:8020/tmp/test_short.csv",make.input.format(format="csv",sep=","))
mydata=data$val

似乎可以使用此方法获取mydata,然后执行object = to.dfs(mydata),但问题是test_short.csv文件很大,大约是TB大小,内存不能保持from.dfs !!

的输出

实际上,我想知道我是否直接使用“hdfs://172.16.1.58:8020 / tmp / test_short.csv”作为mapreduce输入,而在map函数内部执行from.dfs()的事情,我能够获取数据块?

请给我一些建议,无论如何!

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

mapreduce(input = path,input.format = make.input.format(...),map ...)

from.dfs用于小数据。在大多数情况下,您不会在map函数中使用from.dfs。参数保留了部分输入数据

答案 1 :(得分:0)

您可以执行以下操作:

r.file <- hdfs.file(hdfsFilePath,"r")
from.dfs(
    mapreduce(
         input = as.matrix(hdfs.read.text.file(r.file)),
         input.format = "csv",
         map = ...
))

请给出积分并希望有人发现它有用。

注意:有关详细信息,请参阅stackoverflow帖子:

How to input HDFS file into R mapreduce for processing and get the result into HDFS file

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