转换“非规范化”哈希

时间:2013-08-23 12:03:39

标签: ruby-on-rails ruby metaprogramming

我正在处理一个包含“非规范化”键的文件,并将其读入哈希值。

哈希部分看起来像这样:

:primer_left_0_sequence=>"TCCTTCCTGCAGCCATGAAG",    :primer_right_0_sequence=>"GGCCTCGGCACTTACTTCAT", :primer_left_0=>"90,20", :primer_right_0=>"195,20", :primer_left_0_tm=>"60.035", :primer_right_0_tm=>"60.108", :primer_left_0_gc_percent=>"55.000", :primer_right_0_gc_percent=>"55.000"

稍后重复使用相同的密钥,但密钥中的嵌入数字不同:

:primer_left_2_sequence=>"TTCTCTCCCTCCTTCCTGCA", :primer_right_2_sequence=>"GGCCTCGGCACTTACTTCAT", :primer_left_2=>"81,20", :primer_right_2=>"195,20", :primer_left_2_tm=>"59.883", :primer_right_2_tm=>"60.108", :primer_left_2_gc_percent=>"55.000",

它重复几次,每次嵌入密钥的整数可能不同。 我想将这些数据加载到一个表中,其中列名与键相同,但没有嵌入整数。每次有一组新的重复信息时,我都会插入一个新行。

这样的东西,但我无法弄清楚如何处理嵌入到密钥中的整数:

rawfile_hash.each do |key, value|
  # if a new key integer, then create a new record
  # ie: primer3_output = Primer3Output.new
  if primer3_output.class.accessible_attributes.include?(key)
    primer3_output.send("#{key}=", value)
  end
end

修改

为了清楚起见,我正在寻找有效的代码:

primer3_output = Primer3Output.new    
primer3_output.primer_left_sequence = rawfile_hash[:primer_left_0_sequence]
primer3_output.primer_right_sequence = rawfile_hash[:primer_right_0_sequence]
... many entries later ...
primer3_output.save
primer3_output = Primer3Output.new
primer3_output.primer_left_sequence = rawfile_hash[:primer_left_2_sequence]
primer3_output.primer_right_sequence = rawfile_hash[:primer_right_2_sequence]
... etc ...

如果重新打开,我会将其添加为答案。

作为佣金任务

namespace :db do
  task load_table: :environment do
    results = []
    row = 0
    File.open(Rails.root.join("lib", "assets", "P3_INPUT_577_8328_1197.raw"), "r").each_line do |line|
    key, value = line.strip.split("=")
    id = key.scan(/\d+/).first.to_i
    column_name = key.gsub(/_\d+/, "").downcase
    results[id] = {"primer3_parameter_id" => id} unless results[id]
    results[id][column_name] = value
    if id > row
      PrimerPair.create!(results[row])
      results[row] = nil
      row = id
    end
  end
  PrimerPair.create!(results.last)
end

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

很难准确衡量你想要做什么,但从我可以从你那里得到的问题来看,这应该有用;

rawfile_hash.each do |key, value|
  # if a new key integer, then create a new record
  # ie: primer3_output = Primer3Output.new
  key.gsub!(/_\d+/,"") # simple regex
  if primer3_output.class.accessible_attributes.include?(key)
    primer3_output.send("#{key}=", value)
  end
end

修改

Re:您的评论如下 - 您可以在数据库中包含一个额外的列,并按该值查找或创建记录,这样您仍然可以按它排序。像这样的东西;

i = key.gsub(/[^0-9]/,"").to_i
key = key.gsub(/_\d+/,"")
Primer3Output.find_or_create_by(:i => i)