R中的时间序列层次/分组

时间:2013-08-29 10:37:04

标签: r time-series hierarchical-data

我有一个关于R中时间序列的分层分组的问题。我目前有这个矩阵:

           A      B     C      F     G      H      I
[1,] -33.697  8.610 42.31 17.465 24.84 14.210 10.632
[2,]  -4.698 15.993 20.69  6.222 14.47  3.423 11.047
[3,] -37.458  9.687 47.14 14.659 32.49 12.759 19.726
[4,] -23.851 16.517 40.37 14.392 25.98  9.438 16.538
[5,]   3.329 15.629 12.30  3.449  8.85  2.635  6.215
[6,] -38.071  5.746 43.82 15.932 27.89 14.113 13.772

通过检查,我可以弄明白:

  • G = H + I
  • C = F + G
  • A = B - C

有没有办法可以在R的大时间序列中自动找到这些和关系(正面和负面)?我尝试使用lm()来计算关系,但这对于每个系列来说都太费时了。更不用说很多时候存在共线性问题。

非常感谢!

structure(list(A = c(-33.6970557915047, -4.69841752527282, -37.457728596637, 
-23.8508993089199, 3.32904924079776, -38.0712462896481), B = c(8.60984595282935, 
15.9929901333526, 9.68719404516742, 16.5167794595473, 15.6285679822322, 
5.74573907931335), C = c(42.306901744334, 20.6914076586254, 47.1449226418044, 
40.3676787684672, 12.2995187414344, 43.8169853689615), F = c(17.4649945173878, 
6.22195235290565, 14.6593122615013, 14.3921482057776, 3.44929573708214, 
15.9315551938489), G = c(24.8419072269462, 14.4694553057197, 
32.4856103803031, 25.9755305626895, 8.8502230043523, 27.8854301751126
), H = c(14.2098777298816, 3.42268325854093, 12.7592747195158, 
9.43778987810947, 2.63517117220908, 14.1129822209477), I = c(10.6320294970647, 
11.0467720471788, 19.7263356607873, 16.5377406845801, 6.21505183214322, 
13.7724479541648)), .Names = c("A", "B", "C", "F", "G", "H", 
"I"), row.names = c(NA, -6L), class = "data.frame")

3 个答案:

答案 0 :(得分:2)

这也使用了回归,但它

  • 使用比lm.fit更快的lm。 (也存在fastLm 你可以试试rcppArmadillo和rcppEigen。)

  • 通过仅使用唯一组合来避免重复回归。

  • 假设只需要调查三元组,减少计算量(因为这似乎是帖子中的情况)

  • 假设所有系数都是整数来清理输出

代码是:

eps <- .1
combos <- combn(ncol(DF), 3)
for(j in 1:ncol(combos)) {
    ix <- combos[, j]
    fit <- lm.fit(as.matrix(DF[ix[-1]]), DF[[ix[1]]])
    SSE <- sum(resid(fit)^2)
    if (SSE < eps) {
        ecoef <- round(c(-1, coef(fit)))
        names(ecoef)[1] <- names(DF)[ix[1]]
        print(ecoef)
    }
}

给出了帖子中的数据:

 A  B  C 
-1  1 -1 
 C  F  G 
-1  1  1 
 G  H  I 
-1  1  1 

答案 1 :(得分:0)

您可以尝试使用分层聚类方法。这不会给你确切的关系和系数,但可以让你知道你应该测试的关系。首先,我们准备您的数据。

a<-rbind(c(-33.697,8.610,42.31, 17.465, 24.84, 14.210, 10.632), 
  c(-4.698,15.993,20.69,6.222, 14.47,3.423, 11.047),
  c(-37.458,9.687, 47.14, 14.659, 32.49, 12.759, 19.726),
  c(-23.851,16.517,40.37,14.392,25.98,9.438,16.538),
  c(3.329,15.629,12.30,3.449,8.85,2.635,6.215),
  c(-38.071,5.746,43.82,15.932,27.89,14.113,13.772))
colnames(a)<-c("A", "B", "C", "F", "G", "H", "I")

然后我们计算你的变量之间的相关性并创建我们然后聚类的距离。

dd <- as.dist((1 - cor(a))/2)
plot(hclust(dd))

这应该让你了解不同时间序列之间的关系。结果图如下所示。

The plot of the cluster dendrogram

答案 2 :(得分:0)

您可以找到与MASS::Null的线性依赖关系。 它们相当于,但不像你通过目视检查那样稀疏。

library(MASS)
Null(t(d)) # One relation per column
#             [,1]        [,2]        [,3]
# [1,]  0.41403998 -0.04178588  0.45582586
# [2,] -0.41403998  0.04178588 -0.45582586
# [3,] -0.02626794 -0.52439443  0.49812649
# [4,]  0.44030792  0.48260856 -0.04230063
# [5,]  0.62687195 -0.01159430 -0.36153375
# [6,] -0.18656403  0.49420285  0.31923312
# [7,] -0.18656403  0.49420285  0.31923312
as.matrix(d) %*% Null(t(d))  # zero
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