Question

我正在尝试使用Bioconductor类中的hgu95av2.db和GO.db库。

我有一个基因名单。

Genename1
Genename2
Genename3

这些是来自genedb的标准基因名称。

我现在想要获得与之关联的相关go.ids。我希望将来使用此信息来存储数据。

我试图通过annotationapi帮助文件，他们说获取ID的一种方法是使用此api，如下所示：

select(hgu95av2.db, keys=keys, cols=c("GO"),
  keytype="GENENAME")

我不确定如何设置密钥。我是否只使用键列表设置了一个列对象。

当我尝试执行并运行上面的命令时，我收到以下错误：

.testIfKeysAreOfProposedKeytype（x，keys，keytype）出错：输入的密钥均不是指定密钥类型的有效密钥。

我玩过keytype并且总是得到同样的错误，这让我觉得我从根本上不了解如何使用这个数据库查询工具。

我在bioconductor中进行了搜索，他们只是假设我有一个以affy矩阵格式表达的数据，我只有一个基因名列表。

我很感激你的帮助和道歉，因为我是一个新手，并且在R bioconductor界面上并不是很清楚。

非常感谢