Question

有没有办法从%%bash或其他%%script单元格中访问当前python内核中的变量？

也许是命令行参数或环境变量？

Answer 1

Python变量可以在%%bash或%%script单元格的第一行中访问，因此可以作为命令行参数传递给脚本。例如，使用bash，您可以执行以下操作：

%%bash -s "$myPythonVar" "$myOtherVar"
echo "This bash script knows about $1 and $2"

-s命令行选项允许您将位置参数传递给bash，通过$n访问第n个位置参数。请注意，实际分配给bash位置变量的是str(myPythonVariable)的结果。如果您传递包含引号字符（或其他bash敏感字符）的字符串，则需要使用反斜杠转义它们（例如：\"）。

引号很重要 - 如果没有它们，python变量（字符串表示）将在空格上分割，因此如果myPythonVar是datetime.datetime且str(myPythonVar)为"2013-10-30 05:04:09.797507"，则上面的bash脚本会收到3个位置变量，前两个变量值为2013-10-30和05:04:09.797507。它的输出将是：

This bash script knows about 2013-10-30 and 05:04:09.797507

如果你想命名变量而你正在运行linux，这是一种方法：

%%script env my_bash_variable="$myPythonVariable" bash
echo myPythonVariable\'s value is $my_bash_variable

您可以指定多个变量分配。再次提防引号和其他类似的事情（这里bash会痛苦地抱怨！）。要了解其工作原理，请参阅env手册页。

Answer 2

要在使用语法!<some command>运行的bash命令中包含python变量，您可以使用{<variable>}，如下所示：

In [1]: for i in range(3):
   ...:     !echo {i+1}
   ...:     
1
2
3

虽然这与OP提出的略有不同，但它与执行脚本任务密切相关且有用。 This post有更多关于在IPython和Jupyter笔记本中使用shell命令的技巧和示例。

Answer 3

一个问题是，如果要提供给bash的变量是列表，则它不能按预期方式工作。

例如，在一个python单元格中：

l = ['A', 'B', 'C']

然后，如果将其直接提供给魔术选项的下一个单元格：

%%bash -s "$l"
for i in $1
do
echo $i
done

它会像这样奇怪地分裂：

['A',
'B',
'C']

最简单的答案是将代码放在大括号{}中，以将python列表转换为bash列表，如下所示：

%%bash -s "{" ".join(l)}"
for i in $1
do
echo $i
done

给出预期的输出：

A
B
C

Answer 4

注意一个变体，如果你需要将一个简单变量以外的东西传递给bash脚本：

%%bash -s $dict['key1'] $dict['key2'] $dict['key3']

可怕的错误，但

%%bash -s {dict['key1']} {dict['key2']} {dict['key3']}

效果很好。

Answer 5

如果像我这样的人最终在这里寻找在使用 ! 运行命令时如何使用 Python 变量，只需在变量前添加 $ 前缀即可：

!echo $foobar

Answer 6

不，%%script魔法是自动生成的，不会进行任何神奇的进程间数据通信。（对于%%R来说不是这种情况，但是在R个人的额外照顾下，这是一个独立的魔法

但是编写自己的魔法并不难做到。

Answer 7

如果你愿意定义一个新的魔法，你可以使用 Python 字符串模板：

from IPython import get_ipython
from IPython.core.magic import register_cell_magic

ipython = get_ipython()


@register_cell_magic
def pybash(line, cell):
    ipython.run_cell_magic('bash', '', cell.format(**globals()))

然后如果你在 Python 中定义一个变量，例如：

test = 'Python variables'

你可以使用它：

%%pybash
echo '{test} will be expanded'
echo '{{double braces will be replaced with single braces}}'

结果：

Python variables will be expanded
{double braces will be replaced with single braces}

我可以在`%% bash`或`%% script` ipython笔记本单元格中访问python变量吗？

7 个答案: