Question

我想知道是否/如何在foreach dopar循环中返回多个输出。

让我们举一个非常简单的例子。假设我想在foreach循环中执行2个操作，并希望为i的每个值返回或保存两个操作的结果。

只返回一个输出，它将如下所示：

library(foreach)
library(doParallel)
cl <- makeCluster(3)
registerDoParallel(cl)

oper1 <- foreach(i=1:100000) %dopar% {
    i+2
}

oper1将是一个包含100000个元素的列表，每个元素都是i的每个值的操作i+2的结果。

现在假设我想分别返回或保存两个不同操作的结果，例如i+2和i+3。我尝试了以下方法：

oper1 = list()
oper2 <- foreach(i=1:100000) %dopar% {
    oper1[[i]] = i+2
    return(i+3)
}

希望i+2的结果会保存在列表oper1中，并且i+3将返回第二个操作foreach的结果。但是，列表oper1中没有任何内容填充！在这种情况下，只有i+3的结果从循环中返回。

有没有办法在两个单独的列表中返回或保存两个输出？

Answer 1

不要尝试使用foreach或任何其他并行程序包的副作用。而是返回列表中foreach循环体的所有值。如果您希望最终结果是两个列表的列表而不是100,000个列表的列表，那么请指定一个转换结果的组合函数：

comb <- function(x, ...) {
  lapply(seq_along(x),
    function(i) c(x[[i]], lapply(list(...), function(y) y[[i]])))
}

oper <- foreach(i=1:10, .combine='comb', .multicombine=TRUE,
                .init=list(list(), list())) %dopar% {
  list(i+2, i+3)
}

oper1 <- oper[[1]]
oper2 <- oper[[2]]

请注意，此组合函数需要使用.init参数来设置第一次调用combine函数时x的值。

Answer 2

我更喜欢使用一个类来保存％dopar％循环的多个结果。

此示例旋转3个核心，计算每个核心上的多个结果，然后将结果列表返回给调用线程。

在RStudio，Windows 10和R v3.3.2下测试。

library(foreach)
library(doParallel)

# Create class which holds multiple results for each loop iteration.
# Each loop iteration populates two properties: $result1 and $result2.
# For a great tutorial on S3 classes, see: 
# http://www.cyclismo.org/tutorial/R/s3Classes.html#creating-an-s3-class
multiResultClass <- function(result1=NULL,result2=NULL)
{
  me <- list(
    result1 = result1,
    result2 = result2
  )

  ## Set the name for the class
  class(me) <- append(class(me),"multiResultClass")
  return(me)
}

cl <- makeCluster(3)
registerDoParallel(cl)
oper <- foreach(i=1:10) %dopar% {
   result <- multiResultClass()
   result$result1 <- i+1
   result$result2 <- i+2
   return(result)
}
stopCluster(cl)

oper1 <- oper[[1]]$result1
oper2 <- oper[[1]]$result2

Answer 3

此玩具示例显示如何从％dopar％循环返回多个结果。

这个例子：

旋转3个核心。
在每个核心上呈现图表。
返回图表和附加消息。
打印图表及其附加的消息。

我发现这对于加快使用Rmarkdown将1,800个图形打印到PDF文档中非常有用。

在Windows 10，RStudio和R v3.3.2下进行了测试。

R代码：

# Demo of returning multiple results from a %dopar% loop.
library(foreach)
library(doParallel)
library(ggplot2)

cl <- makeCluster(3)
registerDoParallel(cl)

# Create class which holds multiple results for each loop iteration.
# Each loop iteration populates two properties: $resultPlot and $resultMessage.
# For a great tutorial on S3 classes, see: 
# http://www.cyclismo.org/tutorial/R/s3Classes.html#creating-an-s3-class
plotAndMessage <- function(resultPlot=NULL,resultMessage="?")
{
  me <- list(
    resultPlot = resultPlot,
    resultMessage = resultMessage
  )

  # Set the name for the class
  class(me) <- append(class(me),"plotAndMessage")
  return(me)
}

oper <- foreach(i=1:5, .packages=c("ggplot2")) %dopar% {

  x <- c(i:(i+2))
  y <- c(i:(i+2))
  df <- data.frame(x,y)
  p <- ggplot(df, aes(x,y))
  p <- p + geom_point()

  message <- paste("Hello, world! i=",i,"\n",sep="")

  result <- plotAndMessage()
  result$resultPlot <- p
  result$resultMessage <- message
  return(result)
}

# Print resultant plots and messages. Despite running on multiple cores,
# 'foreach' guarantees that the plots arrive back in the original order.
foreach(i=1:5) %do% {
  # Print message attached to plot.
  cat(oper[[i]]$resultMessage)
  # Print plot.
  print(oper[[i]]$resultPlot)
}

stopCluster(cl)

保存foreach dopar loop的多个输出

3 个答案: