Question

我一直在尝试通过R查询来自PostgreSQL数据库的数据。我尝试使用几个不同的包（RODBC, RJDBC, DBI, RPostgres等）对猫进行换肤，但我似乎不断收到驱动程序错误。奇怪的是，我从来没有使用相同的驱动程序/ URL和设置从SQLWorkbench / J连接到Postgres。

我尝试过使用postgresql-9.2-1002.jdbc4.jar和postgresql-9.3-1100.jdbc41.jar以及R中的通用"PostgreSQL"驱动程序。两个jar文件是（i）我一直使用的驱动程序使用SQLWorkbench / J和（ii）分别使用相同驱动程序的稍新版本。然而，当我尝试使用它时......

drv_custom <- JDBC(driverClass = "org.postgresql.Driver", classPath="/Users/xxxx/postgresql-9.3-1100.jdbc41.jar")

我收到错误：

Error in .jfindClass(as.character(driverClass)[1]) : class not found

好的，接下来我尝试使用通用驱动程序：

drv_generic <- dbDriver("PostgreSQL")

奇怪的是，它不希望我输入用户名：

>con <- dbConnect(drv=drv_generic, "jdbc:postgresql://xxx.xxxxx.com", port=xxxx,     uid="xxxx", password="xxxx")
>Error in postgresqlNewConnection(drv, ...) : unused argument (uid = "xxxx")

所以我在没有用户/ uid的情况下尝试：

con＆lt; - dbConnect（drv_generic，“jdbc：postgresql：//padb-01.jiwiredev.com：5439”，password =“paraccel”）

并收到错误....

Error in postgresqlNewConnection(drv, ...) : 
RS-DBI driver: (could not connect jdbc:postgresql://padb-01.xxx.com:5439@local on dbname "jdbc:postgresql://xxxx.xxxx.com:5439")

显然语法错了？

然后我回过头来尝试“自定义”驱动程序（前面的.jar文件之一），但没有指定driverClass。

drv_custom1＆lt; - JDBC（classPath =“/ Users / xxxx / postgresql-9.2-1002.jdbc4.jar”）

con＆lt; - dbConnect（drv = drv_custom1，“jdbc：postgresql：//xxx.xxx.com”，port = 5439，uid =“paraccel”，pwd =“paraccel”）

并收到此错误：

Error in .jcall(drv@jdrv, "Ljava/sql/Connection;", "connect", as.character(url)[1],  : 
RcallMethod: attempt to call a method of a NULL object.

我再次尝试了一下，但语法略有改动：

con <- dbConnect(drv=drv_custom1, url="jdbc:postgresql://xxxx.xxxx.com", port=xxxx, uid="xxxx", pwd="xxxxx",dsn="xxxx")

并得到了同样的错误。我也尝试了许多其他的变化/方法。我认为我的困惑部分来自这样一个事实：文档在DBI之类的包之间以及像RJDBC这样的基础之间以非常零碎的方式处理，因此当我查看诸如?dbConnect之类的文档时，很多甚至没有提到我需要指定的选项，而且我一直在根据与这些包/错误相关的各种Google搜索结果开展工作。

我找到的一个帖子建议尝试

.jaddClassPath( "xxxxx/postgresql-9.2-1002.jdbc4.jar" )

首先，但这似乎没有帮助。

我也尝试过使用

x <- PostgreSQL(max.con = 16, fetch.default.rec = 500, force.reload = FALSE)

无济于事，我试验了RODBC作为驱动程序。

更新：

我尝试使用较旧版本的驱动程序（jdbc3而不是jdbc4），重新启动R，并分离所有不必要的软件包。

我能够加载驱动程序

> drv_custom <- JDBC(driverClass = "org.postgresql.Driver", classPath="/xxxxx/xxxxx/postgresql-9.3-1100.jdbc3.jar")

但我还是无法连接...

> con <- dbConnect(drv=drv_custom, "jdbc:postgresql://xxxxx.xxxxx.com", port=5439, uid="xxxxx", pwd="xxxxx")
Error in .verify.JDBC.result(jc, "Unable to connect JDBC to ", url) : 
Unable to connect JDBC to jdbc:postgresql://xxxxx.xxxx.com

Answer 1

这对我有用：

library(RJDBC)
drv <- JDBC("org.postgresql.Driver","C:/R/postgresql-9.4.1211.jar")
con <- dbConnect(drv, url="jdbc:postgresql://host:port/dbname", user="<user name>", password="<password>")

诀窍是在port中加入dbname和url。出于某种原因，jdbc:postgresql似乎不喜欢从dbConnect参数中读取这些信息。

如果您不确定dbname是什么，可能是postgres。
如果您不确定port是什么，可能是5432。

所以典型的电话会是这样的：

con <- dbConnect(drv, url="jdbc:postgresql://10.10.10.10:5432/postgres", user="<user name>", password="<password>")

您可以从https://jdbc.postgresql.org/

获取jar文件

Answer 2

对IRC进行了一些故障排除，但这是必须发生的事情：

我需要清除工作区，分离RODBC和RJDBC，然后重新启动
加载RPostgreSQL
仅使用通用驱动程序
将语法修改为

con <- dbConnect(drv=drv_generic, "xxx.xxx.com", port=vvvv, user="ffff", password="ffff", dbname="ggg")

注意：删除jdbc：postgresql：part是关键。这对RJDBC来说是必要的，但RJDBC原来是一条不必要的痛苦路线。

Postgres DB无法通过RJDBC连接到R.

2 个答案: