将数据框中的列名称收集到R中的列表中

时间:2013-12-03 14:43:56

标签: r igraph edge vertex

所以我现在有一个工作数据框,但我想研究数据框主题的起源。以下是我用于创建数据框的一些代码:

df <- as.data.frame(t(test)) #This is so the row names are products
    vertices <- row.names(df)
    place <- colnames(df)
    L <- length(vertices)
    numedges <- choose(L,2)
    edges <- data.frame(v1=rep(NA, numedges), v2=NA, numrows=NA, location=NA)
    k <- 0
    for(i in 1:(L-1)) {
    for(j in (i+1):L) {
      k <- k + 1
      edges$v1[k] <- vertices[i]
      edges$v2[k] <- vertices[j]
      edges$numrows[k] <- sum(df[vertices[i], ]=="Yes" & df[vertices[j], ]=="Yes")
      edges$location[k] ### Here is my problem!!!
    }}

我希望输出看起来像:

edges
          v1                    v2     numrows location #What I would like to see
1        Fish                 Squid       8    Town 1, Town 2, Town 4 
2        Fish                Fruits       0    Town 1
3        Fish                  Wood       0    Town 1
4        Fish                   Etc       2    Town 1, Town 2
5        Fish                  Corn       1    Town 1

我认为numrows成为所有边缘的总和?如果我错了,请纠正我。所以我想收集满足numrow函数的所有位置。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

问题不明确。您不知道如何将属性添加到图形边缘?例如,要添加属性位置,您只需执行此操作:

E(g)$location=colnames(df)  ## g is your graph

您可以使用

进行检查
get.edge.attribute(g, 'location')

例如,我可以使用属性位置来设置边缘标签。

library(igraph)
g <- graph.ring(5)
V(g)$size <- 5
E(g)$location=paste(letters[1:5],LETTERS[1:5],sep=':')
E(g)$label <- get.edge.attribute(g, 'location') 
E(g)$label.cex <- 2
plot(g)

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