Question

还是一个Python新手，所以请放轻松我...

我已经设置了字典：

new_dict

我想过滤以返回键，其中每个键附加的任何值与我设置的现有列表中的值匹配：

list(data.Mapped_gene)

有什么想法吗？

编辑：我仍然无法完成这项工作。

如果有帮助，csv表和键都是字符串。

以下是扩大理解的完整代码：

import csv    
new_dict = {}
with open(raw_input("Enter csv file (including path)"), 'rb') as f:
  reader = csv.reader(f)
  for row in reader:
    if row[0] in new_dict:
      new_dict[row[0]].append(row[1:])
    else:
      new_dict[row[0]] = row[1:]
print new_dict

#modified from: http://bit.ly/1iOS7Gu
import pandas
colnames = ['Date Added to Catalog',    'PUBMEDID', 'First Author', 'Date',     'Journal',  'Link', 'Study',    'DT',   'Initial Sample Size',  'Replication Sample Size',  'Region',   'Chr_id',   'Chr_pos',  'Reported Gene(s)', 'Mapped_gene',  'p-Value',  'Pvalue_mlog',  'p-Value (text)',   'OR or beta',   '95% CI (text)',    'Platform [SNPs passing QC]',   'CNV']
data = pandas.read_csv('C:\Users\Chris\Desktop\gwascatalog.csv', names=colnames)


my_list = list(data.Mapped_gene)
my_set = set(my_list)

[k for k, v in new_dict.items() if any(x in my_set for x in v)]

错误讯息： “TypeError：unhashable type：'list'”

Answer 1

使用any和列表理解：

my_list = list(data.Mapped_gene)
keys = [k for k, v in new_dict.items() if any(x in my_list for x in v)]

如果my_list很大，请先将其转换为set，因为它会提供O(1)次查找。

Answer 2

geneset = set(data.Mapped_gene)
[k for k, v in new_dict.items() if geneset.intersection(v)]

Answer 3

要提高查找性能，请将列表转换为集合。

gene_set = set(data.Mapped_gene)

然后使用其他示例中显示的列表理解或字典理解如果你对这个价值感兴趣的话。

{k:v for k, v in my_dict.iteritems() if v in gene_set}

如果iteritems()很大，my_dict上的方法my_dict方法特别有用。为了使您的方法更有效，您可以使用生成器而不是列表或字典理解：

(k for k, v in my_dict.iteritems() if v in gene_set)

根据现有列表过滤字典

3 个答案: