用igraph绘制R中的大图

Question

我试图绘制一个拥有200,000个节点和8百万个边缘的网络。我使用的代码在这里：

library(igraph)
file.choose()
xlist<-read.graph("/Users/quyao/Desktop/redstar_relation.txt", format="ncol", directed=TRUE)
xlist
png('my_png.png', width = 1600, height =900)
plot(xlist)
dev.off()

我明白了：

用这种图片研究拓扑很困难。你有什么建议吗？

由于节点和边缘太多，通过参数'layout'更改布局可能不太有用。

使用我的代码构建这张照片花了大约一个半小时，我怎么能让它更快？

非常感谢。

Answer 1

考虑使用其他软件进行可视化。我通常将Gephi用于幅值最大为15万个节点的图。

但是，这实际上取决于您的计算机有多少RAM（我的内存有8 GB）。还可以通过修改Gephi的配置文件来扩展给Gephi的RAM分配（它不会像RStudio中那样自动分配。