您在R中使用哪些最佳实践进行编程？

Question

R中的编程有哪些好的做法？

由于R是一种我不会一直使用的特殊用途语言，因此我通常会将一些快速脚本放在一起，这些脚本可以满足我的需求。

但是，编写干净，高效的R代码的一些技巧是什么？

Answer 1

您已经提供了一些提示，说明您的方法是'破解快速脚本'。如果您需要最佳实践和结构，请简单地遵循CRAN中已建立的最佳实践：

• 创建一个包，这打开了运行R CMD check的大门，非常有用
• 正如许多人所说，有一个软件包可以帮助你进行代码编写阶段，因为你有点被迫记录代码;这是一件好事（TM）
• 一旦有了一个软件包，请在文档的\examples{}部分添加代码，因为这将在R CMD check期间运行，并且可以轻松进入回归测试
• 一旦习惯了回归测试，就开始使用RUnit之类的包;真的是最佳实践
• JD指向Google Style Guide的指针也很好。这不是唯一的风格指南，例如Henrik's R Coding Convention在它之前几年;还有Hadley's riff on Google's style guide
• 否则，老人 - 但是金子'做你的同事和共同作者所做的'也适用

Answer 2

我推荐Josh Reich的负载，清洁，功能，来自this previous question的工作流程。

此外，我建议遵循Google's R Style Guide等编码指南。使用编码样式指南使得以后阅读代码变得更加容易。

Answer 3

我完全同意现有的答案，特别是关于包的使用。软件包需要大量的规程，文档和结构，这确实有助于实施最佳实践（以及R CMD CHECK）。您也可以使用the codetools package来帮助解决此问题。使用roxygen包进行记录。

除此之外，我建议您不仅要对代码进行矢量化，更重要的是，尽一切努力对函数进行矢量化，这意味着您应该能够提供向量参数并返回向量（甚至来自数据库调用之类的东西）。从长远来看，这将真正提高您的代码效率和清晰度。

最后，我非常喜欢使用像Sweave这样的东西，在编写报告时将我的代码组织成清晰的文字可重复研究。除此之外，我建议使用缓存包。

Answer 4

为了提高效率，首选for循环上的向量操作。

Answer 5

这是一般的编程实践，但使用SVN等版本控制系统来管理代码。