library(WGCNA)loadNamespace中的错误

时间:2014-03-30 11:22:00

标签: r

我重新安装了RSTUDIO& R从头开始。
什么包装"诉mpute"?它不是compute.es

另外,如果有人知道如何摆脱KANJI /汉字,请告诉我; 已经删除所有其他语言只留下英语&重新启动。

也许没有' impute'对于3.0.3?

install.packages中的警告:   package诉mpute·不可用(对于R版本3.0.3)

感谢

----------------------------------------------- --------------

(R)库(WGCNA) loadNamespace出错(j< - i [[1L]],c(lib.loc,.libPaths()),versionCheck = vI [[j]]):   没有名为tak mpute的包。错误:糎GCNA的包或命名空间加载失败· (R)sessionInfo() R版本3.0.3(2014-03-06) 平台:x86_64-w64-mingw32 / x64(64位)

区域设置: [1] LC_COLLATE = English_United States.1252 LC_CTYPE = English_United States.1252
[3] LC_MONETARY = English_United States.1252 LC_NUMERIC = C
[5] LC_TIME = English_United States.1252

附加基础包:  [1]平行样条曲线网格数据集grDevices stats graphics tcltk utils
[10]方法基础

其他附件包:  [1] compute.es_0.2-3 mlbench_2.1-1 randomGLM_1.02-1 doParallel_1.0.8
 [5] iterators_1.0.6 MASS_7.3-29 Hmisc_3.14-3 Formula_1.1-1
 [9] survival_2.37-7 lattice_0.20-27 flashClust_1.01-2 dynamicTreeCut_1.60-1 [13] RODBC_1.3-10 ada_2.0-3 rpart_4.1-5 foreach_1.4.1
[17] stringr_0.6.2 debug_1.3.1 snow_0.3-13 ROCR_1.0-5
[21] gplots_2.12.1 rattle_3.0.2 RSNNS_0.4-4 Rcpp_0.11.1

通过命名空间加载(而不是附加):  [1] bitops_1.0-6 caTools_1.16 cluster_1.14.4 codetools_0.2-8
 [5] compiler_3.0.3 gdata_2.13.2 gtools_3.3.1 KernSmooth_2.23-10  [9] latticeExtra_0.6-26 matrixStats_0.8.14 mvbutils_2.7.4.1 R.methodsS3_1.6.1
[13] RColorBrewer_1.0-5 tools_3.0.3

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

来自:http://labs.genetics.ucla.edu/horvath/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/

install.packages(c(“dynamicTreeCut”,“cluster”,“flashClust”,“Hmisc”,“reshape”,“foreach”,“doParallel”)) 源( “http://bioconductor.org/biocLite.R”) biocLite(“impute”)

(R)库(WGCNA)

* *包装WGCNA 1.34装。 * *重要提示:您的系统似乎支持多线程, *但是在WGCNA中没有启用它。 *要在WGCNA中允许所有可用内核进行多线程,请使用 * * allowWGCNAThreads() * *在R.内使用disableWGCNAThreads()可在必要时禁用线程。 *或者,在系统上设置以下环境变量: * * ALLOW_WGCNA_THREADS = * * 例如 * * ALLOW_WGCNA_THREADS = 4 * *要在linux bash shell中设置环境变量,请键入 * * export ALLOW_WGCNA_THREADS = 4 * *在运行之前R.其他操作系统或shell将会 *有类似的命令来达到同样的目标。

*

附加包装:糎GCNA· 以下对象被掩盖了丛织:统计数据

cor