Question

编辑：

非常感谢user20650，他的答案解决了这个问题。但是，如果有人知道为什么 .Rprofile文件会影响Ubuntu 12.04上的lme4安装，请提供建议，因为我真的很想知道。

原帖：

我试图安装doBy软件包并遇到一些问题。这取决于lme4，由于某种原因，它不是从我迄今为止尝试过的任何来源编译的。我已经访问了SO上的一些链接，包括this one，并且没有取得任何成功。

以下是我在安装时遇到的错误摘要。我尝试了三种不同的方法，如下所述。任何人都知道是否有lme4的某些内容？

尝试1：

> install.packages('doBy')
# ...
# ERROR: compilation failed for package ‘lme4’
# * removing ‘/home/richard/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/lme4’
# Warning in install.packages :
#   installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
# 
# Successfully loaded .Rprofile at Wed May 21 13:33:34 2014 
# ERROR: dependency ‘lme4’ is not available for package ‘doBy’
# * removing ‘/home/richard/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/doBy’
# Warning in install.packages :
#   installation of package ‘doBy’ had non-zero exit status

尝试2：

> install.packages("lme4",repos = "http://r-forge.r-project.org")
# Installing package into ‘/home/richard/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1’
# (as ‘lib’ is unspecified)
# Warning in install.packages :
#   package ‘lme4’ is not available (for R version 3.1.0)

尝试3：

> install_github(repo = 'lme4/lme4', username = 'stevencarlislewalker')

enter image description here

运行Ubuntu 12.04 LTS

> version
# _                           
# platform       x86_64-pc-linux-gnu         
# arch           x86_64                      
# os             linux-gnu                   
# system         x86_64, linux-gnu           
# status                                     
# major          3                           
# minor          1.0                         
# year           2014                        
# month          04                          
# day            10                          
# svn rev        65387                       
# language       R                           
# version.string R version 3.1.0 (2014-04-10)
# nickname       Spring Dance

Answer 1

这（可能）可能不是理查德Q的答案。但确实复制了我在lme4 ubuntu 12,04上安装Rv3.1的问题。如果其他人可以重现这一点，那就太好了。

所以继续我的评论 - 注意到Richard有一个.Rprofile，在.First导致的包中定义.Last和.Rprofile不安装。

<强>〔实施例

首先卸载lme4

remove.packages("lme4")

定义 .Rprofile 文件

## .First() run at the start of every R session.
.First <- function() {
cat("\nSuccessfully loaded your .Rprofile at", date(), "\n")
}

## .Last() run at the end of the session
.Last <- function() {
cat("\nGoodbye at ", date(), "\n")
}

打开R

尝试安装lme4 - 没有成功＆amp;与Richard的上述相似的错误

install.packages("lme4")

...
* removing ‘/home/admin1/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.1/lme4’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status

在终端

中重命名（或删除） .Rprofile 文件

mv .Rprofile temp.Rprofile

再次打开 R 并尝试安装lme4

install.packages("lme4")

...
* installing vignettes
** testing if installed package can be loaded
* DONE (lme4)

 library(lme4)
# Loading required package: Matrix
# Loading required package: Rcpp

Answer 2

这是一个错误，应该由this commit在开发版本（在Github上）和版本1.1-7中修复（很快就会出现？）

Answer 3

根据您的评论和扩展问题：

您可以通过将R 3.1.0安装到Ubuntu 12.04上来拍摄自己。
您现在运行的R与发行版中的r-cran-lme4等程序包不同步。
好消息是你可以询问发行版有关所谓的Build-Depends知道的信息，并在R 3.1.0下重建lme4
或者可以从迈克尔在启动板上的其他工作中受益，并使用他的其他回购，例如r-travis代码：sudo add-apt-repository -y "ppa:marutter/rrutter"后跟和sudo add-apt-repository -y "ppa:marutter/c2d4u"
< / LI>

最后一步将为您提供大量预先构建的软件包。从长远来看，你当然最好能够自己从源代码构建软件包......

Answer 4

 sudo apt-get install r-base-dev

解决了我的问题

lme4软件包安装在Ubuntu 12.04上失败

4 个答案: