Question

我只是想知道是否可以通过sqldf或RSQLite将R列表直接存储在SQLite数据库中（当然也可以检索它们）。

Answer 1

在这里看到我的另一个，更好的答案：

https://stackoverflow.com/a/26098290/134830

像列表这样的粗糙对象不适合数据库表的矩形特性。您可以通过几种方法来解决此限制。

使用dput将列表转换为文本，并将其存储在文本列中。当你从数据库中检索它时，dget。

您还可以将数据作为XML或JSON存储在文本列中，并在检索时解析它。

如果您不关心可读的内容，您也可以使用saveRDS将其存储为二进制blob（并使用readRDS检索）。

所有这些方法的缺点是您无法对它们进行数据库内分析。它们仅适用于将数据库用作数据存储介质。

如果您想在数据库中处理数据，则必须make it rectangular。

有关RDS方法的更多详细信息。这实际上比我最初预料的更痛苦，因为是的，你需要写入文件。

l <- list(x = 1:5, y = letters)

saveRDS(l, "tmp")
bits <- readBin("tmp", "raw", 1000)
# Then send the raw data to the DB

# On retrieval reverse the process
writeBin(x, "tmp")
readRDS("tmp")

可能更容易替代RDS方法。

bits <- charToRaw(paste0(deparse(l), collapse = ""))

# And the reverse:
eval(parse(text = rawToChar(bits)))

Answer 2

好的，发帖前略有错误的搜索，c.f。

Storing R Objects in a relational database

让我们详细说明一个最小的工作示例：

library(RSQLite)
db <- dbConnect(SQLite(), dbname = "test.sqlite")
dbSendQuery(conn = db, "CREATE TABLE test (ID INTEGER, DATA STRING)")
l <- list("super", "important", "stuff")
dbSendQuery(conn = db, sprintf("INSERT INTO test VALUES (1, '%s')", 
                               rawToChar(serialize(l, NULL, TRUE))))
unserialize(charToRaw(dbReadTable(db, "test")$DATA))

快乐的编码！

如何在SQLite数据库中存储R对象（列表）？

2 个答案: