在R中查找“完整”组

时间:2014-09-29 12:31:39

标签: r

我有一个包含组和子组的大型数据集。我想根据"完整性"过滤数据。这些组中的所有级别(a和b)都应该出现

一个小例子

group <- rep(c("A", "B", "C"), each=5)
a <- c(1,1,2,2,3,1,1,1,3,3,1,2,2,3,3)
b <- c("a", "a", "a", "b", "c", "a", "a", "a", "b", "c", "a", "b", "b", "b", "b")
df <- data.frame(group, a, b)

     group a b
1      A 1 a
2      A 1 a
3      A 2 a
4      A 2 b
5      A 3 c
6      B 1 a
7      B 1 a
8      B 1 a
9      B 3 b
10     B 3 c
11     C 1 a
12     C 2 b
13     C 2 b
14     C 3 b
15     C 3 b

所以这里只有A被认为是完整的,因为a和b的所有级别都会出现。是否有一种有效(灵活)的方法来过滤这些条件?

3 个答案:

答案 0 :(得分:3)

我会做这样的事情:

sapply(split(df, df$group), function(x) all(a %in% x$a) & all(b %in% x$b))
##    A     B     C 
##  TRUE FALSE FALSE 

答案 1 :(得分:2)

我会尝试data.table,例如

library(data.table)
setDT(df)[, indx := length(unique(a)) + length(unique(b))]
df[, indx2 := length(unique(a)) + length(unique(b)), by = group]
df[indx == indx2]
#    group a b indx indx2
# 1:     A 1 a    6     6
# 2:     A 1 a    6     6
# 3:     A 2 a    6     6
# 4:     A 2 b    6     6
# 5:     A 3 c    6     6

或者对于更通用的解决方案,您可以指定列名称,然后使用.SDcols,例如

cols <- c("a", "b")
setDT(df)[, indx := Reduce(sum, lapply(.SD, function(x) length(unique(x)))), .SDcols = cols]
df[, indx2 := Reduce(sum, lapply(.SD, function(x) length(unique(x)))), .SDcols = cols, by = group]
df[indx == indx2]

答案 2 :(得分:2)

以下是dplyr解决方案:

library(dplyr)

df %>%
  group_by(group) %>%
  mutate(
    a_complete = all(unique(df$a) %in% a),
    b_complete = all(unique(df$b) %in% b)
  ) %>%
  filter(a_complete, b_complete) %>%
  select(- ends_with("complete"))
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