Question

我需要使用c＃和一些免费库将JPEG图像保存为DICOM。我阅读了很多主题，其中描述了如何做相反的事情，但我无法在任何地方找到如何执行我需要的东西。我能做的最好的事情是使用ClearCanvas保存图像，但它会变形。

DicomFile dicomFile = new DicomFile();
dicomFile.MediaStorageSopClassUid = SopClass.DigitalXRayImageStorageForPresentation.Uid;
dicomFile.DataSet[DicomTags.SopClassUid].SetStringValue(SopClass.DigitalXRayImageStorageForPresentation.Uid);
dicomFile.TransferSyntax = TransferSyntax.ExplicitVrLittleEndian;
dicomFile.DataSet[DicomTags.ImageType].SetStringValue(@"ORIGINAL\PRIMARY");
dicomFile.DataSet[DicomTags.Columns].SetInt32(0, width);
dicomFile.DataSet[DicomTags.Rows].SetInt32(0, height);
dicomFile.DataSet[DicomTags.BitsStored].SetInt16(0, bitsPerPixel);
dicomFile.DataSet[DicomTags.BitsAllocated].SetInt16(0, 8);
dicomFile.DataSet[DicomTags.HighBit].SetInt16(0, 7);
dicomFile.DataSet[DicomTags.PixelData].Values = imageBuffer;
dicomFile.Save("e:\\tempFile.dcm");

有人可以告诉我上面的代码有什么问题，或者在其他任何免费图书馆提供一个简单的工作示例吗？

Answer 1

这是一些代码，但我就是这样做的。这似乎是一个重复的常见问题。我随着时间的推移从Clear Canvas论坛中将它拼凑在一起，但这是对所提问题的完全有效的答案。

如果需要从标准图像文件（例如jpg）创建DICOM Secondary Capture图像，并且您希望它们能够与所有PACS，VNA和其他DICOM应用程序一起正常工作，那么这里的代码适用于此。

好的我必须再编辑一次。我拼凑起来玩得很开心，我只需要能够做到这一点。我创建的一些DICOM图像添加到了我的测试套件中，但我比它更有趣。我拿着荷马辛普森的脑图并将其包裹起来。当放射科医生采取自拍时，也可以使用自拍照。图片。不要忘记我做的最后一个，最近新闻中有一张高质量的海鳗X射线照片，所以我把它包裹在DICOM中。因此你看到的例子。

好的还有一个编辑。自写这个答案以来，我发现了这个代码非常有价值的能力。我可以以任何方式生成像素数据来测试我们的产品。我已经可以用Explicit Little Endian生成DICOM图像，10,000 X 10,000像素，这肯定会导致DICOM产品出现问题，但我可以使用Clear Canvas生成它而没有问题！

我还可以使用这个代码使用简单的小型5 x 5像素图像发送数据，这对于测试快速构建大型数据库或增加某些积压数据有很大帮助。我只希望别人认为这和我一样有用。

using ClearCanvas.Dicom.Codec;
using ClearCanvas.Common.Utilities;
using ClearCanvas.Dicom;
using ClearCanvas.Dicom.Network;
using ClearCanvas.Common;
using ClearCanvas.ImageViewer;
using ClearCanvas.ImageViewer.Imaging;
using ClearCanvas.ImageViewer.Graphics;
using ClearCanvas.ImageViewer.StudyManagement;





            DicomFile df = null;
            Bitmap bm = LoadImage(tbImageFile.Text);
            CreateBaseDataSet();
            df = ConvertImage(bm, 1);
            df.Save(@"C:\test.dcm", DicomWriteOptions.Default);

然后这是剩下的所有内容：

    private void CreateBaseDataSet()
    {
        _baseDataSet = new DicomAttributeCollection();

        //Sop Common
        _baseDataSet[DicomTags.SopClassUid].SetStringValue(SopClass.SecondaryCaptureImageStorageUid);

        ////Patient
        //_baseDataSet[DicomTags.PatientId].SetStringValue(_parent.PatientId);
        //_baseDataSet[DicomTags.PatientsName].SetStringValue(String.Format("{0}^{1}^{2}^^",
        //                                                                  _parent.LastName, _parent.FirstName, _parent.MiddleName));

        //_baseDataSet[DicomTags.PatientsBirthDate].SetDateTime(0, _parent.Dob);
        //_baseDataSet[DicomTags.PatientsSex].SetStringValue(_parent.Sex.ToString());

        ////Study
        //_baseDataSet[DicomTags.StudyInstanceUid].SetStringValue(DicomUid.GenerateUid().UID);
        //_baseDataSet[DicomTags.StudyDate].SetDateTime(0, _parent.StudyDate);
        //_baseDataSet[DicomTags.StudyTime].SetDateTime(0, _parent.StudyTime);
        //_baseDataSet[DicomTags.AccessionNumber].SetStringValue(_parent.AccessionNumber);
        //_baseDataSet[DicomTags.StudyDescription].SetStringValue(_parent.StudyDescription);


        //Patient
        _baseDataSet[DicomTags.PatientId].SetStringValue("PIDEEL");
        _baseDataSet[DicomTags.PatientsName].SetStringValue(String.Format("Moray^Eel^X-Ray"));
        //_baseDataSet[DicomTags.PatientsAddress].SetString (0,"Hubertus");
        //_baseDataSet[DicomTags.PatientsBirthDate].SetDateTime(0, DateTime.Now);
        //_baseDataSet[DicomTags.PatientsBirthDate].SetString(0, "19550512");

        _baseDataSet[DicomTags.PatientsSex].SetStringValue("O");

        //Study
        _baseDataSet[DicomTags.StudyInstanceUid].SetStringValue(DicomUid.GenerateUid().UID);
        _baseDataSet[DicomTags.StudyDate].SetDateTime(0, DateTime.Now);
        _baseDataSet[DicomTags.StudyTime].SetDateTime(0, DateTime.Now);
        _baseDataSet[DicomTags.AccessionNumber].SetStringValue("ACCEEL");
        _baseDataSet[DicomTags.StudyDescription].SetStringValue("X-Ray of a Moray Eel");

        _baseDataSet[DicomTags.ReferringPhysiciansName].SetNullValue();
        _baseDataSet[DicomTags.StudyId].SetNullValue();

        //Series
        _baseDataSet[DicomTags.SeriesInstanceUid].SetStringValue(DicomUid.GenerateUid().UID);
        _baseDataSet[DicomTags.Modality].SetStringValue("OT");
        _baseDataSet[DicomTags.SeriesNumber].SetStringValue("1");

        //SC Equipment
        _baseDataSet[DicomTags.ConversionType].SetStringValue("WSD");

        //General Image
        _baseDataSet[DicomTags.ImageType].SetStringValue(@"DERIVED\SECONDARY");
        _baseDataSet[DicomTags.PatientOrientation].SetNullValue();


        _baseDataSet[DicomTags.WindowWidth].SetStringValue("");
        _baseDataSet[DicomTags.WindowCenter].SetStringValue("");

        //Image Pixel
        if (rbMonoChrome.Checked )
        {
                _baseDataSet[DicomTags.SamplesPerPixel].SetInt32(0, 1);
                _baseDataSet[DicomTags.PhotometricInterpretation].SetStringValue("MONOCHROME2");
                _baseDataSet[DicomTags.BitsAllocated].SetInt32(0, 8);
                _baseDataSet[DicomTags.BitsStored].SetInt32(0, 8);
                _baseDataSet[DicomTags.HighBit].SetInt32(0, 7);
                _baseDataSet[DicomTags.PixelRepresentation].SetInt32(0, 0);
                _baseDataSet[DicomTags.PlanarConfiguration].SetInt32(0, 0);
        }
        if (rbColor.Checked)
        {
                _baseDataSet[DicomTags.SamplesPerPixel].SetInt32(0, 3);
                _baseDataSet[DicomTags.PhotometricInterpretation].SetStringValue("RGB");
                _baseDataSet[DicomTags.BitsAllocated].SetInt32(0, 8);
                _baseDataSet[DicomTags.BitsStored].SetInt32(0, 8);
                _baseDataSet[DicomTags.HighBit].SetInt32(0, 7);
                _baseDataSet[DicomTags.PixelRepresentation].SetInt32(0, 0);
                _baseDataSet[DicomTags.PlanarConfiguration].SetInt32(0, 0);
        }
    }



    private DicomFile ConvertImage(Bitmap image, int instanceNumber)
    {
        DicomUid sopInstanceUid = DicomUid.GenerateUid();

        string fileName = @"C:\test.dcm";// String.Format("{0}.dcm", sopInstanceUid.UID);
        //fileName = System.IO.Path.Combine(_tempFileDirectory, fileName);


        DicomFile dicomFile = new DicomFile(fileName, new DicomAttributeCollection(), _baseDataSet.Copy());

        //meta info
        dicomFile.MediaStorageSopInstanceUid = sopInstanceUid.UID;
        dicomFile.MediaStorageSopClassUid = SopClass.SecondaryCaptureImageStorageUid;

        //General Image
        dicomFile.DataSet[DicomTags.InstanceNumber].SetInt32(0, instanceNumber);

        DateTime now = Platform.Time;
        DateTime time = DateTime.MinValue.Add(new TimeSpan(now.Hour, now.Minute, now.Second));

        //SC Image
        dicomFile.DataSet[DicomTags.DateOfSecondaryCapture].SetDateTime(0, now);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.TimeOfSecondaryCapture].SetDateTime(0, time);

        //Sop Common
        dicomFile.DataSet[DicomTags.InstanceCreationDate].SetDateTime(0, now);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.InstanceCreationTime].SetDateTime(0, time);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.SopInstanceUid].SetStringValue(sopInstanceUid.UID);

        //int rows, columns;
        //Image Pixel


        if (rbMonoChrome.Checked)
        {
            dicomFile.DataSet[DicomTags.PixelData].Values = GetMonochromePixelData(image, out rows, out columns);
        }

        if (rbColor.Checked)
        {
            dicomFile.DataSet[DicomTags.PixelData].Values = GetColorPixelData(image, out rows, out columns);
        }


        //Image Pixel
        dicomFile.DataSet[DicomTags.Rows].SetInt32(0, rows);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.Columns].SetInt32(0, columns);

        return dicomFile;
    }



    private static byte[] GetMonochromePixelData(Bitmap image, out int rows, out int columns)
    {
        rows = image.Height;
        columns = image.Width;

        //At least one of rows or columns must be even.
        if (rows % 2 != 0 && columns % 2 != 0)
            --columns; //trim the last column.

        int size = rows * columns;
        //byte[] pixelData = MemoryManager.Allocate<byte>(size);
        byte[] pixelData = new byte[size];
        int i = 0;

        for (int row = 0; row < rows; ++row)
        {
            for (int column = 0; column < columns; column++)
            {
                pixelData[i++] = image.GetPixel(column, row).R;
            }
        }

        return pixelData;
    }



    private static byte[] GetColorPixelData(Bitmap image, out int rows, out int columns)
    {
        rows = image.Height;
        columns = image.Width;

        //At least one of rows or columns must be even.
        if (rows % 2 != 0 && columns % 2 != 0)
            --columns; //trim the last column.

        BitmapData data = image.LockBits(new Rectangle(0, 0, columns, rows), ImageLockMode.ReadOnly, image.PixelFormat);
        IntPtr bmpData = data.Scan0;

        try
        {
            int stride = columns * 3;
            int size = rows * stride;

            //byte[] pixelData = MemoryManager.Allocate<byte>(size);
            byte[] pixelData = new byte[size];

            for (int i = 0; i < rows; ++i)
                Marshal.Copy(new IntPtr(bmpData.ToInt64() + i * data.Stride), pixelData, i * stride, stride);

            //swap BGR to RGB
            SwapRedBlue(pixelData);
            return pixelData;
        }
        finally
        {
            image.UnlockBits(data);
        }
    }




private static Bitmap LoadImage(string file)
{
    Bitmap image = Image.FromFile(file, true) as Bitmap;
    if (image == null)
        throw new ArgumentException(String.Format("The specified file cannot be loaded as a bitmap {0}.", file));

    if (image.PixelFormat != PixelFormat.Format24bppRgb)
    {
        Platform.Log(LogLevel.Info, "Attempting to convert non RBG image to RGB ({0}) before converting to Dicom.", file);

        Bitmap old = image;
        using (old)
        {
            image = new Bitmap(old.Width, old.Height, PixelFormat.Format24bppRgb);
            using (Graphics g = Graphics.FromImage(image))
            {
                g.DrawImage(old, 0, 0, old.Width, old.Height);
            }
        }
    }

    return image;
}

private static void SwapRedBlue(byte[] pixels)
{
    for (int i = 0; i < pixels.Length; i += 3)
    {
        byte temp = pixels[i];
        pixels[i] = pixels[i + 2];
        pixels[i + 2] = temp;
    }
}

如何将图像保存为DICOM

1 个答案: