测试R中固定效应和随机效应之间相互作用的重要性。正确的语法?

时间:2014-10-28 16:30:04

标签: r syntax mixed-models lmer random-effects

我正在使用R中的lmer进行混合模型,我对某些编码有点困惑。我测量了35个自交系(基因型)在果蝇中的雄性和雌性健康状况超过三个区块。

我的回答变量是健身' n = 10个人/性别/行/块测试。

性别是固定的,Block是随机的,并且嵌套在块中的行是随机的。我主要对性和线之间的相互作用感兴趣。因此我的模型看起来像

m1<-lmer(FitnessCured~Sex+(1|Block/Line)+(1|Block)+(1|Sex:Line),noNAdata)

如果我想测试Sex:Line互动的重要性,我的计划是将上述模型与没有互动的模型进行比较,并使用anova来比较两个模型

e.g. m2<-lmer(FitnessCured~Sex+(1|Block/Line)+(1|Block),noNAdata)
anova(m1,m2)

然而我想知道的是,如果我正在测试Sex:Line交互的重要性(包含为随机效应),R知道Line是否嵌套在Block ???中

如何指定嵌套在Block ??

中的Sex by Line之间的交互

应该是

 m1T<-lmer(FitnessCured~Sex+(1|Block/Line)+(1|Block)+(1|Sex:Block:Line)   

任何想法都将不胜感激。我在下面列出了我的数据样本

     Block Line Sex FitnessInfected FitnessCured
2        1    2   M          1.4573       0.2215
3        1    2   M          1.1551       1.1379
4        1    2   M          1.4573       1.1379
7        1    2   M          1.4573       0.4108
9        1    2   M         -1.5648       1.1379
11       1    2   F         -0.2669      -1.2473
12       1    2   F          0.2785      -1.2473
13       1    2   F         -0.5396      -1.2473
14       1    2   F         -0.5396       0.4602
15       1    2   F          1.8237      -1.2473
16       1    2   F          0.7330       0.4965
17       1    2   F          1.5511      -1.2473
18       1    2   F         -0.5396       1.4774
19       1    2   F          1.0966       1.1868
20       1    2   F         -0.5396      -1.2473
21       1    3   M          1.2054       0.7162
22       1    3   M          1.2585       0.3146
24       1    3   M         -1.5648       0.2672
26       1    3   M         -0.8932      -0.8615
27       1    3   M          0.5047       1.1379
28       1    3   M          0.7704       1.1379
29       1    3   M         -1.5648      -1.7689
31       1    3   F         -0.5396       0.6782
32       1    3   F         -0.5396      -1.2473
33       1    3   F         -0.5396       1.0778
34       1    3   F         -0.5396      -1.2473
35       1    3   F         -0.5396      -1.2473
36       1    3   F         -0.5396       0.7145
37       1    3   F         -0.5396       0.7508

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