Python多处理队列比pool.map慢

时间:2014-11-15 01:58:11

标签: python performance multiprocessing python-multiprocessing

我最近开始尝试使用多处理来加速任务。我创建了一个执行模糊字符串匹配的脚本,并使用不同的算法计算得分(我想比较不同的匹配技术)。您可以在此处找到完整的来源:https://bitbucket.org/bergonzzi/fuzzy-compare/src。作为输入,它需要2个文件组合成对(file1的每一行与file2的每一行)。对于每对,计算模糊匹配分数。

我制作了3个版本。运行我的仓库中提供的样本数据(成对组合后包含697.340项),我有以下时间:

  • 简单的单一过程 - 0:00:47
  • 使用Pool.map() - 0:00:13
  • 的多进程
  • 使用队列的多进程(生产者/消费者模式) - 0:01:04

我试图理解为什么我的Pool.map()版本比我的Queue版本快得多,这实际上比简单的单一版本慢。

我甚至尝试使用Queues的原因是Pool.map()版本保留了结果,直到所有内容完成并且只在最后写入文件。这意味着对于大文件,它最终会占用大量内存。 I'm talking about this version(链接到它,因为它要粘贴很多代码)。

To solve this I refactored it into a producer/consumer pattern(或至少尝试过)。在这里,我首先通过组合两个输入文件来生成作业,并将它们放入消费者处理的队列中(计算模糊匹配分数)。完成的工作被放入队列中。然后我有一个进程从此队列中获取已完成的项目并将它们写入文件。这样,从理论上讲,我不需要那么多的内存,因为结果会被刷新到磁盘上。它看起来工作正常,但速度要慢得多。我还注意到,在Mac OSX上查看活动监视器时,我产生的4个进程似乎没有使用100%的CPU(Pool.map()版本不是这种情况)。

我注意到的另一件事是我的生产者函数似乎正确地填满了队列,但是消费者进程似乎要等到队列被填满而不是在第一个项目到达时立即开始工作。我可能在那里做错了......

此处参考了Queue版本的一些相关代码(尽管查看上面链接的repo中的完整代码会更好。)

这是我的制片人职能:

def combine(list1, list2):
    '''
    Combine every item of list1 with every item of list 2,
    normalize put the pair in the job queue.
    '''
    pname = multiprocessing.current_process().name
    for x in list1:
        for y in list2:
            # slugify is a function to normalize the strings
            term1 = slugify(x.strip(), separator=' ')
            term2 = slugify(y.strip(), separator=' ')
            job_queue.put_nowait([term1, term2])

这是作家功能:

def writer(writer_queue):
    out = open(file_out, 'wb')
    pname = multiprocessing.current_process().name
    out.write(header)
    for match in iter(writer_queue.get, "STOP"):
        print("%s is writing %s") % (pname, str(match))
        line = str(';'.join(match) + '\n')
        out.write(line)
    out.close()

这是执行实际计算的工作函数(删除了大部分代码,因为它没有在这里产生影响,在repo上有完整的源代码):

def score_it(job_queue, writer_queue):
    '''Calculate scores for pair of words.'''
    pname = multiprocessing.current_process().name

    for pair in iter(job_queue.get_nowait, "STOP"):
        # do all the calculations and put the result into the writer queue
        writer_queue.put(result)

这是我设置流程的方式:

# Files
to_match = open(args.file_to_match).readlines()
source_list = open(args.file_to_be_matched).readlines()

workers = 4
job_queue = multiprocessing.Manager().Queue()
writer_queue = multiprocessing.Manager().Queue()
processes = []

print('Start matching with "%s", minimum score of %s and %s workers') % (
    args.algorithm, minscore, workers)

# Fill up job queue
print("Filling up job queue with term pairs...")
c = multiprocessing.Process(target=combine, name="Feeder", args=(to_match, source_list))
c.start()
c.join()

print("Job queue size: %s") % job_queue.qsize()

# Start writer process
w = multiprocessing.Process(target=writer, name="Writer", args=(writer_queue,))
w.start()

for w in xrange(workers):
    p = multiprocessing.Process(target=score_it, args=(job_queue, writer_queue))
    p.start()
    processes.append(p)
    job_queue.put("STOP")

for p in processes:
    p.join()

writer_queue.put("STOP")

我在这里读了很多关于多处理有时候比较慢的事情,我知道这与创建和管理新进程的开销有关。此外,当要完成的工作不是很大的时候,#34;够了,多处理的效果可能不明显。但是在这种情况下,我认为这个工作非常大,而且Pool.map()版本似乎也证明了这一点,因为它的速度要快得多。

管理所有这些进程并传递队列对象时,我是否做了一些非常错误的事情?如何对其进行优化,以便在处理文件时将结果写入文件,以最大限度地减少运行时所需的内存量?

谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

我认为您的计时问题是您的多线程队列版本缺少优化。你做了一个评论,主要是说你的job_queue在工作线程开始从中获取工作之前就填满了。我相信这个的原因是你在#Fill up job queue中的c.join()。这可以防止主线程继续,直到作业队列已满。我将c.join()移到p.join()之后的末尾。您还需要找到一种方法将停止标志放入队列的末尾。组合功能可能是放置它的好地方。在数据用完之后添加x个停止标志的行。

还有一点需要注意: 你在for循环的范围内写了你的w变量来启动p进程。作为样式/可读性等问题,我将w更改为不同的变量名称。如果你没有使用它,下划线就可以作为一个很好的一次性变量名。 即

for w in xrange(workers):

应该成为

for _ in xrange(workers):

长话短说,如果你将c.join()移到最后,你应该得到更准确的时间。目前,多线程唯一的就是字符串的模糊匹配。拥有生产者/消费者线程的一个优点是消费者线程不必等到生产者线程完成,因此,您最终使用更少的内存。