Question

我想知道如何将bash variable作为pattern传递给awk。我已经阅读了几个Q / As，它们倾向于回答相同的问题，然而，它们都没有解决我的问题（可能，我错过了一些东西！）。

我有几个这样的文件：

1   9909    23121  
1   23121   561510  
3   75879819    75902940  
3   75902940    75916152  
4   75916152    75982212  
3   75982212    75998727  
22  82964754    83232297 
X   59962662    60745473

我希望创建不同的文件，每个文件包含相同的起始模式，我只想提取第2列，例如一个文件，包含以1开头的所有行的第2列，另一个文件包含以X开头的行的第2列等。

我的代码如下所示：

for x in *.CNVs; do  
   for y in `seq 22` X Y; do  
        awk '/^$y/ {print $2}' $x > freec_${x}_${y}_st.txt;  
   done;  
done;

我也尝试使用-v这样的选项：

for x in *.CNVs; do  
    for y in `seq 22` X Y; do  
        awk -v pattern="{$y}" '/^pattern/ {print $2}' $x > freec_${x}_${y}_st.txt;  
    done;  
done;

我没有收到任何错误，所有文件都已创建;但是，它们都是空的！任何建议都非常感谢！

[修改] 我使用grep找到了一种更简洁的方式（以前，我认为grep无法完成！）：

for x in *.CNVs; do
    for y in `seq 22` X Y; do
        grep "^${y}\s" $x | cut -f2 > ${x}_${y}_st.txt;
    done;
done;

使用grep很有帮助，因为通过使用\s，我可以区分以2分，21分和22分等开头的行。

Answer 1

在regexp文字（/.../）中不会扩展变量。您需要使用~运算符和字符串文字。

awk -v pattern="$y" '$0 ~ "^"pattern {print $2}' "$x" > "freec_${x}_${y}_st.txt"

您还需要注意任何模式元字符/等。在模式中。

将bash变量作为模式传递给awk

1 个答案: