在Windows上安装scikit-bio时遇到问题

Question

尝试使用Python 2.78和Visual C ++ 2008 Express Edition在Windows XP上通过pip安装scikit-bio工具包时，该过程会被VC发出以下消息中断：

cl : Command line error D8021 : invalid numeric argument '/Wno-error=declaration
-after-statement' 

关于此错误，Microsoft Developer Network网站只是说：

invalid numeric argument 'number'

A number greater than 65,534 was specified as a numeric argument.

我还没有尝试在Linux下安装scikit-bio（Ubuntu 12.04 Precise），但我觉得它能正常工作（就像Linux一样）。

有没有人成功在Windows下安装scikit-bio（XP，7,8）？任何提示？

提前致谢！

Answer 1

我已经在Windows 10计算机上安装了Anaconda的Python（3.5）。您应该知道，此平台没有正式版本的scikit-bio，但您可以使用此解决方法进行安装：

1. 从Scikit-bio Github repository。
下载最新来源
2. 使用 7-zip 等工具，将其解压缩到您的主目录。

3. 打开命令行客户端并切换到源目录

   cd %HOMEPATH%\scikit-bio-master
   

4. 使用 Notepad ++ 编辑文件 setup.py

   "C:\Program Files (x86)\Notepad++\notepad++" setup.py
   

5. 查找定义了 ssw_extra_compile_args 变量的行并进行更改。您可以评论以前的版本并在新行中重新定义变量：

   #ssw_extra_compile_args = ['-Wno-error=declaration-after-statement']
   ssw_extra_compile_args = []
   

6. 保存更改，关闭编辑器并使用以下命令运行安装：

   python setup.py install
   

7. 希望您不会收到任何错误消息。打开Anaconda的Python会话（使用命令python）并测试是否使用print(skbio.art)正确安装了Scikit-Bio。



顺便说一句，我之前安装了启用了C ++ SDK功能的Visual Studio 2015 Community Edition，以满足编译器对软件包（Scikit-Bio）安装的要求。

Answer 2

目前，scikit-bio还没有正式支持Windows。我们绝对有兴趣了解人们在Windows上安装，测试和使用scikit-bio所做的努力，但我们没有开发人员具备该领域的专业知识。

这与biocore/skbio#941有关。