Question

我正在尝试创建一个脚本，它将遍历目录并打开图像并对其进行分析等。

所以我想将类似下面脚本的东西转换为循环;

//sets the pixel height and width

height = 15; 
width = 15;

//navigates to the folder and opens the image

IJ.run("Raw...", "open=[C:\\Users\\Documents\\Ru\\simulations_Ru\\Batch1_sc\\1 Atoms\\15x15_stem_image00001_total_df_00001.bin] image=[64-bit Real] width=15 height=15 offset=0 number=1 gap=0");


imp = IJ.getImage();

//selects a region of interest I want to make measurements from

imp.setRoi(0, 0, width, height);


//makes the measurement

IJ.run(imp, "Measure", "");


//closes the image

imp.close();

我想知道的是如何将其转换为循环（而不必为每个文件夹键入命令），以便迭代特定文件夹的数量

Answer 1

我如何阅读它，问题更多的是找到如何迭代目录中的文件。几个月前我一直在寻找这个问题，发现很难找到正确的信息，因为关于JavaScript的大部分内容都涉及在浏览器中运行，而无法访问＆＃34 ;本地＆＃34;文件系统......

无论如何，在ImageJ中，可以使用以下JavaScript代码：

importClass(Packages.java.io.File);

var foo = File('/tmp/');
dirlist = foo.list();

for (var i = 0; i < dirlist.length; i++) {
    print(dirlist[i]);
}

所以在＆＃34; for＆＃34;循环你可以打开文件，处理步骤并将结果写入新文件。

Answer 2

height = 15; 
width = 15;

var cmds = //cmds is a shortage of commands
[
     "open=[C:\\Users\\Documents\\Ru\\simulations_Ru\\Batch1_sc\\1 Atoms\\15x15_stem_image00001_total_df_00001.bin] image=[64-bit Real] width=15 height=15 offset=0 number=1 gap=0",
     "another command",
     "and so on..."
];

for(var i in cmds)
{
  IJ.run("Raw...", cmds[i]);


  imp = IJ.getImage();
  imp.setRoi(0, 0, width, height);
  IJ.run(imp, "Measure", "");

  imp.close();
}

ImageJ JavaScript，如何在目录中循环？

2 个答案: