Question

我想知道你们是否可以帮助我建立一个邻接矩阵。我有CVS格式的数据，如下所示：

Paper_ID    Author
2   Foster-McGregor, N.
3   Van Houte, M.
4   van de Meerendonk, A.
5   Farla, K.
6   van Houte, M.
6   Siegel, M.
8   Farla, K.
11  Farla, K.
11  Verspagen, B.

正如您可以看到列＆＃34; Paper_ID＆＃34;重复值为11，意味着＆＃34; Farla，K。＆＃34;和＆＃34; Verspagen，B。＆＃34;是出版物的共同作者。我需要使用作者的名字建立一个方形加权矩阵，计算他们合作的时间。

Answer 1

以下是否符合您的要求？

# simulate data.
d <- data.frame(
  id=c(2,3,4,5,6,6,8,11,11,12,12),
  author=c("FN", "VM","VA","FK","VM","SM","FK","FK","VB","FK","VB")
)

d
   id author
1   2     FN
2   3     VM
3   4     VA
4   5     FK
5   6     VM
6   6     SM
7   8     FK
8  11     FK
9  11     VB
10 12     FK
11 12     VB

# create incidence matrix:
m <- xtabs(~author+id,d)
m
      id
author 2 3 4 5 6 8 11 12
    FK 0 0 0 1 0 1  1  1
    FN 1 0 0 0 0 0  0  0
    SM 0 0 0 0 1 0  0  0
    VA 0 0 1 0 0 0  0  0
    VB 0 0 0 0 0 0  1  1
    VM 0 1 0 0 1 0  0  0

# convert to adjacency matrix.
# tcrossprod does "m %*% t(m)"
tcrossprod(m)
      author
author FK FN SM VA VB VM
    FK  4  0  0  0  2  0
    FN  0  1  0  0  0  0
    SM  0  0  1  0  0  1
    VA  0  0  0  1  0  0
    VB  2  0  0  0  2  0
    VM  0  0  1  0  0  2

请注意，crossprod()会为您提供id变量的关联矩阵（即t(m) %*% m}。

建立和邻接矩阵

1 个答案: