Question

我有2个文本文件，行数相同，但我的文件之间没有公共列。第一个文件有9列，第二个文件有8列。它们都有111557行。 2个文件中的行顺序是相同的，所以我只想简单地合并它们，这意味着我将有一个包含17列的文本文件。

这是第一个.txt文件的第一列（它们是标签限制的）

     chr1   HAVANA  gene    29554   31109   .   +   .

这是第二个.txt文件的第一行（它们是标签限制的）

     ENSG00000243485.2  ENSG00000243485.2   lincRNA NOVEL   MIR1302-11  lincRNA NOVEL   MIR1302-11

Answer 1

import csv

with open('path/to/file1') as infile1, open('path/to/file2') as infile2, open('path/to/output', 'w') as outfile:
    writer = csv.writer(outfile, delimiter='\t')
    for row1,row2 in zip(csv.reader(infile1, delimiter='\t'), csv.reader(infile2, delimiter='\t')):
        writer.writerow(row1+row2)

Answer 2

尝试这样：

with open('file1') as f1, open('file2') as f2, open('outfile','w') as out:
    for x in f1:
        y = next(f2)
        out.write("{}\t{}".format(x.strip(),y))

如果您在上面收到错误，请尝试这样做：

f1 = open('file1') 
f2 = open('file2')
out = open('outfile','w')
for x in f1:
    y = next(f2)
    out.write(x.strip() + "\t" + y)

在python中合并两个没有公共列的文本文件

2 个答案: