如何读取压缩的DICOM文件

时间:2015-01-06 00:57:16

标签: java macos dicom

我正在寻找一种用Java读取压缩DICOM文件的方法。使用Jpeg2000压缩DICOM。 Java高级映像IO在MAC OS中没有库,因此我在使用DCM4CHE时遇到问题。 ImageJ也不支持压缩的DICOM文件。

File myDicomFile = new File("IM-0001-0001.dcm");
    try {
        DicomInputStream dis = new DicomInputStream(myDicomFile);
        Iterator<ImageReader> iter = ImageIO.getImageReadersByFormatName("DICOM");
        ImageReader reader = (ImageReader) iter.next();
        DicomImageReadParam param = (DicomImageReadParam) reader.getDefaultReadParam();
        ImageInputStream iis = ImageIO.createImageInputStream(myDicomFile);
        reader.setInput(iis, false);
        BufferedImage bi = reader.read(0, param);

        File myJpegFile = new File("IM-0001-0001.jpg");
        OutputStream output = new BufferedOutputStream(new FileOutputStream(myJpegFile));
        JPEGImageEncoder encoder = JPEGCodec.createJPEGEncoder(output);
        encoder.encode(bi);
        output.close();
    } catch (Exception e) {
        System.out.println(e.getStackTrace());
    }

上面的代码适用于未压缩的DICOM,但是使用压缩的DICOM会产生以下错误:

Exception in thread "main" java.lang.UnsatisfiedLinkError: com.sun.medialib.codec.jp2k.Decoder.decode_init(Ljavax/imageio/stream/ImageInputStream;J)J
at com.sun.medialib.codec.jp2k.Decoder.decode_init(Native Method)
at com.sun.medialib.codec.jp2k.Decoder.<init>(Decoder.java:53)
at com.sun.media.imageioimpl.plugins.jpeg2000.J2KRenderedImageCodecLib.<init>(J2KRenderedImageCodecLib.java:158)
at com.sun.media.imageioimpl.plugins.jpeg2000.J2KImageReaderCodecLib.read(J2KImageReaderCodecLib.java:367)
at org.dcm4che3.imageio.plugins.dcm.DicomImageReader.read(DicomImageReader.java:284)
at Main.main(Main.java:31)

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1 个答案:

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您可以使用GDCM / java绑定。请参阅以下example以供参考。