使用gdcm（Grassroots DICOM）解压缩DICOM图像数据

Question

是否可以使用GDCM的Python包装器来解码DICOM文件中的图像数据？

我有一个byte array / string与DICOM文件中的bytes图像数据（即标记7fe0,0010的内容（“像素数据”））我想将图像解码为原始RGB或灰度。

我正在考虑the lines of this之外的事情，但只使用图像数据，而不是实际DICOM文件本身的路径。

Answer 1

您可以阅读这些示例，其中一个示例显示了如何将输入压缩DICOM转换为未压缩的DICOM。在这里查看代码：

• Decompress Image

如果您是NumPy的忠实粉丝，请结帐：

• This module add support for converting a gdcm.Image to a numpy array.

这是一个低级示例，它显示了如何检索图像的实际原始缓冲区。

处理Transfer Syntax转换的更好的类是使用gdcm.ImageChangeTransferSyntax类（允许解压缩图标）

• gdcm::ImageChangeTransferSyntax Class Reference

如果您不介意阅读一些C ++，您可以将以下代码从C ++简单地转换为Python：

• Compress Image

请注意，此示例实际上是压缩图像，而不是解压缩。

最后，如果您真的只能访问Pixel Data属性中包含的数据值，那么您应该真正了解一下（C＃语法应该接近Python语法）：

• Decompress JPEG File

此示例显示了如何解压缩JPEG Lossless，Nonhierarchical，First-Order Prediction文件。 JPEG数据是从文件中读取的，但如果数据已经存储在您的大小写内存中，则该数据应该有效。