斯皮尔曼 - 成对相关

Question

我有一个看起来像这样的数据框（真正的数据框有7000多行和17列）：

     V1    V2   V3    V4
1    93    98   79    170
2    17    17   22    85
3    1    57    137   320
4    9    1     0     440
5    NA    NA   NA    22

我想为每列进行成对的spearman相关，并提取每个成对比较的相关系数估计值。

我尝试了rcor功能，但输出只是NA：

rcor.test(data.matrix(data), method = "spearman")

      V1        V2        V3      V4
V1    ******    NA        NA      NA
V2    <0.001    *****     NA      NA
V3    <0.001    <0.001    *****   NA
V3    <0.001    <0.001    <0.001  *****

我不确定我做错了什么，我试图将数据框用作矩阵但没有运气

有什么想法吗？

Answer 1

我遇到了类似的问题，use="pairwise.complete.obs"解决了这个问题