将PIL图像转换为skimage?

时间:2015-04-28 19:46:22

标签: python arrays image numpy pep3118

我的代码中加载了一个图片(非常长且不必要,在此处发布),我需要使用skimage来检测图像中的斑点。但是出于某些原因,我使用的所有图像和尝试都不起作用。

在上面的代码中,PIL修改了图像,使我试图找到的对象只有白色(255,255,255),所有其他像素都是黑色。此代码只需要识别这些位置。我已经尝试了许多不同的东西来使它工作(将它们转换为numpy数组,而不是将它们转换为numpy数组等。)

我遵循这些说明:http://scikit-image.org/docs/dev/auto_examples/plot_blob.html了解基础知识,但这不是一个教程,更多的例子。

我认为rgb2gray函数存在问题,因为它只返回0,而print(numpy.array(img))返回0到1之间的值,这表明信息丢失是在调用rgb2gray时。

以下代码似乎有问题:

img_gray = rgb2gray(numpy.array(img)) # Convert to numpy array for skimage
print(img_gray)
print(numpy.array(img))
img_blobs = blob_doh(img_gray, threshold=0.01, max_sigma=500)
print(img_blobs)

我该如何解决这个问题?

修改

以下是每个图像,数组和列表的打印内容:

[[ 0.          0.          0.         ...,  0.          0.          0.        ] #img_gray
 [ 0.          0.00392157  0.01568627 ...,  0.          0.          0.        ]
 [ 0.          0.01176471  0.05882353 ...,  0.          0.          0.        ]
 ..., 
 [ 1.          0.99607843  0.96078431 ...,  0.          0.          0.        ]
 [ 1.          1.          0.98039216 ...,  0.          0.          0.        ]
 [ 1.          1.          0.99215686 ...,  0.          0.          0.        ]]
[[[  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]
  ..., 
  [  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]

 [[  0   0   0] #img
  [  1   1   1]
  [  4   4   4]
  ..., 
  [  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]

 [[  0   0   0] #img
  [  3   3   3]
  [ 15  15  15]
  ..., 
  [  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]

 ..., 
 [[255 255 255] #img
  [254 254 254]
  [245 245 245]
  ..., 
  [  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]

 [[255 255 255] #img
  [255 255 255]
  [250 250 250]
  ..., 
  [  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]

 [[255 255 255]
  [255 255 255]
  [253 253 253]
  ..., 
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]]
[] #img_blobs

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

这会将图像文件(使用PIL)读入scimage:

from skimage import io
img = io.imread("./path/to/image.png")

由于您已经阅读了图像并希望自己进行数据转换,因此您可以查看插件作者如何在此处执行此操作: https://github.com/scikit-image/scikit-image/blob/master/skimage/io/_plugins/pil_plugin.py