cca使用素食主义者：没有无约束的惯性

Question

我使用素食主义者进行CCA分析，其中有7500个位点，9个物种和5个约束变量。结果是 ＆GT;

Call: cca(sitspe = Yp, sitenv = Xp)

            Inertia Proportion Rank
Total                              
Constrained  0.5051               6
Inertia is mean squared contingency coefficient 

Eigenvalues for constrained axes:
[1] 0.3317 0.1301 0.0328 0.0089 0.0014 0.0003

我不明白为什么没有无约束或全惯性？

Answer 1

可能你的约束轴解释了一切，并没有留下约束的惯性。你在无约束的任命中获得了多少轴（没有约束的CCA）？

您的数据实际上是非正方形的：矩阵维度是7500倍9.只有9种，如果这些是依赖的或者是多余的，您可以用约束解释所有内容。