字符X

Question

我正在寻找sed命令来丢弃从＆＃34;＆gt;＆＃34;开始的行中的第11个字符（从而保留第一个字符）。所以我最想要的是改变这个文件

>LEP004_Iphiclides_podalirius
GCCTCGGCTCACTTGGAAGGTGG

>LEP054_Danaus_plexippus
GGTCGTTGACCTCACTGTTTGCA

进入以下一个：

>LEP004_Ip
GCCTCGGCTCACTTGGAAGGTGG

>LEP054_Da
GGTCGTTGACCTCACTGTTTGCA

我尝试了这个命令：sed -n＆＃39; /＆gt; / {s / ^（。{10}）。* / \ 1 / g; p}＆＃39; seq.fas＆gt; seq_modif.fas但它只输出序列标题（而不是DNA序列）

谢谢！

Answer 1

您可以使用此sed命令：

sed '/^>/s/^\(.\{10\}\).*/\1/' file
>LEP004_Ip
GCCTCGGCTCACTTGGAAGGTGG

>LEP054_Da
GGTCGTTGACCTCACTGTTTGCA

Answer 2

这可能适合你（GNU sed）：

File.open("file.txt", "r+") do |file|

  file.gets "marker"
  file.gets

  lines_to_insert.each do |line|
    file.puts line
  end

  # EOF here
  file.truncate(file.pos)

end

Answer 3

以下是awk版本：

$ awk '/^>/ {$0=substr($0,1,10)} 1' seq.fas