R项目/包开发的ESS工作流程

Question

任何人都可以在ESS下分享他在R peject开发工作流程方面的经验吗？我试过几次学习emacs，但我还没有得到它。我可以将ESS理解为编辑器，但ESS中是否有项目视图？什么是设置/查看R项目目录，编码和测试的有效方法，以及ESS如何有利于整个过程？

您是仅将ESS用作优秀的R编辑器还是倾向于在ESS中模拟R IDE环境？

感谢您的任何建议。

Answer 1

听起来你问的是两个不同的问题。 一个问题涉及工作流程以及使用ESS的其他问题。 当我使用StatET和Eclipse时，我将分享我关于您的问题的工作流程方面的经验。

与Vincent一样，我也遵循Josh Reich在此设置的工作流程（也参见Hadley的有用评论）： Workflow for statistical analysis and report writing

虽然项目之间可能有所不同，但我倾向于有几个主要的R文件

• import.R：这会导入数据文件并执行任何必要的清理和操作
• analyse.R：这会生成任何最终报告所需的输出
• main.R：这会调用import.R和analyse.R

目的是使用import.R和analyse.R来表示产生任何分析的最终结果的完整和最终工作流程。

就分析项目的目录结构而言，我通常还会有以下文件夹

• 数据：用于存储任何原始数据文件
• meta ：用于存储元数据，例如变量标签，测试评分系统，重新编码信息等。
• 输出：用于存储我的分析生成的任何图形，表格或文本，我可能希望将其合并到外部程序中
• temp ：在探索数据和头脑风暴分析时，我喜欢将代码键入文件而不是使用控制台。我倾向于标记这些temp1.R，temp2.​​R，temp3.R。我将它们存储在临时文件夹中。这样我就可以轻松访问永久记录。如果分析成为最终分析，它们将被合并到一个主R文件中（即import.R或analysis.R）
• 函数：如果我认为在几个项目中需要一个函数，我经常将每个文件中的一个函数或一组相关函数放在一个名为functions的文件夹中的文件中。这使得在不需要包开发的形式要求时，跨项目重用函数相对容易。
• 库：如果我想创建一些我认为会特定于项目的常规功能，我会将它们放在此文件夹中
• 保存：用于存储任何已保存的R对象的文件夹

使用StatET和Eclipse可以轻松地与这样的文件系统进行交互。 当然，鉴于所有使用ESS和Emacs的R大师，我确信它也能很好地处理与文件系统的交互。

Answer 2

我不确定你对此的回答是什么。举个例子，我偷了（并改编了）建议here a little while ago (by Josh Reich)的系统：

为每个项目创建一个文件夹，并将您的工作分成许多不同的.R文件：

• Load.R用于将原始数据导入R;
• Prep.R用于清理数据，重新编码变量等;
• Func.R用于编码评估所需的任何自定义函数;和
• Eval.R用于运行你的最终作品。

如果这不符合你的风格，只需改变它。

然后，您可以使用主文件一个接一个地调用每个部分（有利于再现性），或者在不同阶段保存并使各个脚本加载适当的数据（如果某些准备工作有用）是非常计算/时间密集的。）

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另一方面，链接上发布的技巧确实帮助我进入了ESS。它将Shift-Enter转变为一站式ESS商店：http://www.kieranhealy.org/blog/archives/2009/10/12/make-shift-enter-do-a-lot-in-ess/

Answer 3

其他人已经为您提供了一些关于如何为项目设置目录/文件结构的好主意。

您还询问了“项目视图”，在这种情况下，您可能需要查看Emacs Code Browser（ECB）。

您可以在其网站上找到有关它的一些屏幕截图，此处： http://ecb.sourceforge.net/screenshots/index.html