如何用scikit学习多类案例的精确度,召回率,准确度和f1分数?

时间:2015-07-15 04:17:37

标签: python machine-learning nlp artificial-intelligence scikit-learn

我正在处理情绪分析问题,数据看起来像这样:

label instances
    5    1190
    4     838
    3     239
    1     204
    2     127

因此,我的数据不平衡,因为1190 instances标有5。对于分类我使用scikit的SVC。问题是我不知道如何以正确的方式平衡我的数据,以便准确计算多类案例的精确度,召回率,准确度和f1分数。所以我尝试了以下方法:

首先:

    wclf = SVC(kernel='linear', C= 1, class_weight={1: 10})
    wclf.fit(X, y)
    weighted_prediction = wclf.predict(X_test)

print 'Accuracy:', accuracy_score(y_test, weighted_prediction)
print 'F1 score:', f1_score(y_test, weighted_prediction,average='weighted')
print 'Recall:', recall_score(y_test, weighted_prediction,
                              average='weighted')
print 'Precision:', precision_score(y_test, weighted_prediction,
                                    average='weighted')
print '\n clasification report:\n', classification_report(y_test, weighted_prediction)
print '\n confussion matrix:\n',confusion_matrix(y_test, weighted_prediction)

第二

auto_wclf = SVC(kernel='linear', C= 1, class_weight='auto')
auto_wclf.fit(X, y)
auto_weighted_prediction = auto_wclf.predict(X_test)

print 'Accuracy:', accuracy_score(y_test, auto_weighted_prediction)

print 'F1 score:', f1_score(y_test, auto_weighted_prediction,
                            average='weighted')

print 'Recall:', recall_score(y_test, auto_weighted_prediction,
                              average='weighted')

print 'Precision:', precision_score(y_test, auto_weighted_prediction,
                                    average='weighted')

print '\n clasification report:\n', classification_report(y_test,auto_weighted_prediction)

print '\n confussion matrix:\n',confusion_matrix(y_test, auto_weighted_prediction)

第三

clf = SVC(kernel='linear', C= 1)
clf.fit(X, y)
prediction = clf.predict(X_test)


from sklearn.metrics import precision_score, \
    recall_score, confusion_matrix, classification_report, \
    accuracy_score, f1_score

print 'Accuracy:', accuracy_score(y_test, prediction)
print 'F1 score:', f1_score(y_test, prediction)
print 'Recall:', recall_score(y_test, prediction)
print 'Precision:', precision_score(y_test, prediction)
print '\n clasification report:\n', classification_report(y_test,prediction)
print '\n confussion matrix:\n',confusion_matrix(y_test, prediction)


F1 score:/usr/local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/metrics/classification.py:676: DeprecationWarning: The default `weighted` averaging is deprecated, and from version 0.18, use of precision, recall or F-score with multiclass or multilabel data or pos_label=None will result in an exception. Please set an explicit value for `average`, one of (None, 'micro', 'macro', 'weighted', 'samples'). In cross validation use, for instance, scoring="f1_weighted" instead of scoring="f1".
  sample_weight=sample_weight)
/usr/local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/metrics/classification.py:1172: DeprecationWarning: The default `weighted` averaging is deprecated, and from version 0.18, use of precision, recall or F-score with multiclass or multilabel data or pos_label=None will result in an exception. Please set an explicit value for `average`, one of (None, 'micro', 'macro', 'weighted', 'samples'). In cross validation use, for instance, scoring="f1_weighted" instead of scoring="f1".
  sample_weight=sample_weight)
/usr/local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/metrics/classification.py:1082: DeprecationWarning: The default `weighted` averaging is deprecated, and from version 0.18, use of precision, recall or F-score with multiclass or multilabel data or pos_label=None will result in an exception. Please set an explicit value for `average`, one of (None, 'micro', 'macro', 'weighted', 'samples'). In cross validation use, for instance, scoring="f1_weighted" instead of scoring="f1".
  sample_weight=sample_weight)
 0.930416613529

然而,我得到这样的警告:

/usr/local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/metrics/classification.py:1172:
DeprecationWarning: The default `weighted` averaging is deprecated,
and from version 0.18, use of precision, recall or F-score with 
multiclass or multilabel data or pos_label=None will result in an 
exception. Please set an explicit value for `average`, one of (None, 
'micro', 'macro', 'weighted', 'samples'). In cross validation use, for 
instance, scoring="f1_weighted" instead of scoring="f1"

如何才能正确处理不平衡数据,以便以正确的方式计算分类器的指标?

4 个答案:

答案 0 :(得分:128)

我认为关于哪些权重用于什么存在很多混淆。我不确定我究竟是什么困扰你,所以我将涵盖不同的主题,忍受我;)。

班级重量

class_weight参数的权重用于训练分类器。 它们不用于计算您正在使用的任何指标:使用不同的类权重,数字会因为分类器不同而不同。

基本上在每个scikit-learn分类器中,类权重用于告诉您的模型一个类的重要性。这意味着在训练期间,分类器将做出额外的努力来正确地对高权重的类进行分类 他们如何做到这一点是特定于算法的。如果您想了解SVC的工作原理以及文档对您没有意义,请随时提及。

指标

一旦你有了分类器,你想知道它的表现如何。 在这里,您可以使用您提到的指标:accuracyrecall_scoref1_score ......

通常当班级分布不平衡时,准确性被认为是一个不好的选择,因为它给刚刚预测最频繁班级的模型提供了高分。

我不会详细说明所有这些指标,但请注意,除了accuracy之外,它们自然会在类级别应用:正如您在分类报告print中所看到的那样,它们是为每个班级定义。他们依赖true positivesfalse negative等概念来定义哪个类是正面

             precision    recall  f1-score   support

          0       0.65      1.00      0.79        17
          1       0.57      0.75      0.65        16
          2       0.33      0.06      0.10        17
avg / total       0.52      0.60      0.51        50

警告

F1 score:/usr/local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/metrics/classification.py:676: DeprecationWarning: The 
default `weighted` averaging is deprecated, and from version 0.18, 
use of precision, recall or F-score with multiclass or multilabel data  
or pos_label=None will result in an exception. Please set an explicit 
value for `average`, one of (None, 'micro', 'macro', 'weighted', 
'samples'). In cross validation use, for instance, 
scoring="f1_weighted" instead of scoring="f1".

你得到这个警告,因为你正在使用f1-score,召回和精确度,而没有定义它们应该如何计算! 问题可以改写一下:从上面的分类报告中,你如何为f1分数输出一个全局数字? 你可以:

  1. 取每个班级的f1分数的平均值:这是上面的avg / total结果。它也被称为平均值。
  2. 使用真阳性/假阴性等的全局计数计算f1分数(您总结每个类的真阳性/假阴性的数量)。 Aka micro 平均。
  3. 计算f1分数的加权平均值。在scikit-learn中使用'weighted'将通过类的支持来衡量f1分数:一个类具有的元素越多,该类在计算中的f1分数就越重要。
  4. 这些是scikit-learn中的3个选项,警告可以说你必须选择一个。因此,您必须为score方法指定average参数。

    您选择哪一个取决于您希望如何衡量分类器的性能:例如宏观平均不考虑类不平衡,而第1类的f1分数与f1-一样重要第5级的分数。如果你使用加权平均,你将会更加重视第5课。

    这些指标中的整个论证规范现在在scikit-learn中并不是非常明确,根据文档,它在0.18版本中会变得更好。他们正在删除一些非显而易见的标准行为,他们正在发出警告,以便开发人员注意到它。

    计算分数

    我想提及的最后一件事(如果你意识到的话,可以随意跳过它),只有在分类器从未见过的数据计算得分时,分数才有意义。 这非常重要,因为您在拟合分类器时使用的数据得分与完全无关。

    这是使用StratifiedShuffleSplit执行此操作的方法,它可以随机分割您的数据(在随机播放后),以保留标签分布。

    from sklearn.datasets import make_classification
    from sklearn.cross_validation import StratifiedShuffleSplit
    from sklearn.metrics import accuracy_score, f1_score, precision_score, recall_score, classification_report, confusion_matrix
    
    # We use a utility to generate artificial classification data.
    X, y = make_classification(n_samples=100, n_informative=10, n_classes=3)
    sss = StratifiedShuffleSplit(y, n_iter=1, test_size=0.5, random_state=0)
    for train_idx, test_idx in sss:
        X_train, X_test, y_train, y_test = X[train_idx], X[test_idx], y[train_idx], y[test_idx]
        svc.fit(X_train, y_train)
        y_pred = svc.predict(X_test)
        print(f1_score(y_test, y_pred, average="macro"))
        print(precision_score(y_test, y_pred, average="macro"))
        print(recall_score(y_test, y_pred, average="macro"))    
    

    希望这有帮助。

答案 1 :(得分:58)

这里有很多非常详细的答案,但我不认为你正在回答正确的问题。据我了解这个问题,有两个问题:

  1. 如何评分多类问题?
  2. 如何处理不平衡数据?
  3. 1

    你可以使用scikit-learn中的大多数评分函数来解决多类问题和单类问题。例:

    from sklearn.metrics import precision_recall_fscore_support as score
    
    predicted = [1,2,3,4,5,1,2,1,1,4,5] 
    y_test = [1,2,3,4,5,1,2,1,1,4,1]
    
    precision, recall, fscore, support = score(y_test, predicted)
    
    print('precision: {}'.format(precision))
    print('recall: {}'.format(recall))
    print('fscore: {}'.format(fscore))
    print('support: {}'.format(support))
    

    这样,您最终会得到每个班级的有形和可解释的数字。

    | Label | Precision | Recall | FScore | Support |
    |-------|-----------|--------|--------|---------|
    | 1     | 94%       | 83%    | 0.88   | 204     |
    | 2     | 71%       | 50%    | 0.54   | 127     |
    | ...   | ...       | ...    | ...    | ...     |
    | 4     | 80%       | 98%    | 0.89   | 838     |
    | 5     | 93%       | 81%    | 0.91   | 1190    |
    

    则...

    2

    ...你可以判断不平衡数据是否是一个问题。如果较少代表的类(1级和2级)的得分低于具有更多训练样本(4级和5级)的类,则您知道不平衡数据实际上是一个问题,并且您可以相应地采取行动,如在这个帖子中的一些其他答案中描述。 但是,如果您想要预测的数据中存在相同的类别分布,那么您的不平衡训练数据就是数据的良好代表,因此,不平衡是一件好事。

答案 2 :(得分:15)

提出问题

回答“使用不平衡数据进行多级分类应采用什么指标”的问题:Macro-F1-measure。 宏精度和宏调用也可以使用,但它们不像二进制分类那么容易解释,它们已经被合并到F-measure中,而且过多的度量使方法比较,参数调整等变得复杂。

微观平均对类不平衡很敏感:例如,如果您的方法适用于最常见的标签并且完全混淆其他标签,则微观平均指标会显示出良好的结果。

加权平均不太适合不平衡数据,因为它按标签计数加权。此外,它太难以解释和不受欢迎:例如,在以下非常详细的survey中没有提及这种平均值我强烈建议您仔细阅读:

  

Sokolova,Marina和Guy Lapalme。 “系统分析   分类任务的绩效衡量标准。“信息处理   &安培;管理45.4(2009):427-437。

特定于应用的问题

然而,回到你的任务,我将研究2个主题:

  1. 通常用于特定任务的指标 - 它允许(a)到 比较你的方法和其他人,并了解你是否做了什么 错误的,(b)不要自己探索并重用某人 别的发现;
  2. 您的方法的不同错误的成本 - 为 例如,您的应用程序的用例可能依赖于4星和5星 仅审核 - 在这种情况下,良好的指标应仅计入这2个 标签。
  3. 常用指标。 通过阅读文献后我可以推断,有两个主要的评估指标:

    1. Accuracy ,使用了,例如在
    2.   Yu,April,和Daryl Chang。 “多类情绪预测使用   Yelp Business。“

      link) - 请注意作者使用几乎相同的评级分布,见图5.

        Pang,Bo和Lillian Lee。 “看到明星:剥削阶级   关于评级的情绪分类关系   “第四十三届年会的会议记录   计算语言学。计算语言学协会,   2005。

      link

      1. MSE (或者,通常情况下,平均绝对错误 - MAE ) - 请参阅,例如,
      2.   李,Moontae和R. Grafe。 “多类情绪分析与   餐厅评论。“CS N 224(2010)的最终项目。

        link) - 他们探索准确性和MSE,考虑到后者更好

          

        Pappas,Nikolaos,Rue Marconi和Andrei Popescu-Belis。 “解释   星系:基于方面的加权多实例学习   “情绪分析”,“2014年经验会议论文集”   自然语言处理方法。 No. EPFL-CONF-200899。 2014。

        link) - 他们利用scikit-learn进行评估和基线方法,并说明他们的代码是可用的;但是,我找不到它,所以如果你需要它,写信给作者,这项工作很新,似乎是用Python编写的。

        不同错误的成本 如果你更关心避免重大错误,例如对一星级到五星级的评论或类似的东西,看看MSE; 如果差异很重要,但不是那么多,试试MAE,因为它不是方差; 否则保持准确性。

        关于方法,而非指标

        尝试回归方法,例如SVR,因为它们通常优于SVC或OVA SVM等多类分类器。

答案 3 :(得分:12)

首先,使用计数分析判断您的数据是否不平衡有点困难。例如:千分之一的正面观察只是一个噪音,错误或科学上的突破?你永远不会知道。
因此,最好使用所有可用的知识,并明智地选择其状态。

好的,如果它真的不平衡怎么办?
再一次 - 查看您的数据。有时您可以找到一两次观察乘以百次。有时创建这种假的一类观察是有用的 如果所有数据都是干净的,那么下一步就是在预测模型中使用类权重。

那么多类指标呢?
根据我的经验,通常不使用任何指标。主要有两个原因 第一:使用概率而不是实体预测总是更好(因为如果他们都给你相同的类,你怎么能用0.9和0.6预测分离模型?)
第二:根据一个好的指标,比较预测模型和建立新模型要容易得多 根据我的经验,我可以推荐loglossMSE(或只是意味着平方误差)。

如何修复sklearn警告?
只是简单地(正如杨杰注意到的那样)用其中一个覆盖average参数 值:'micro'(全局计算指标),'macro'(计算每个标签的指标)或'weighted'(与宏相同但具有自动权重)。

f1_score(y_test, prediction, average='weighted')

调用具有默认average'binary'的指标函数后,所有警告都出现了,这不适用于多类预测。
祝你好运,享受机器学习的乐趣!

修改
我发现另一个回答者建议切换到我不能同意的回归方法(例如SVR)。据我记得,甚至没有多类回归这样的东西。是的,有多标签回归,这是非常不同的,是的,在某些情况下,有可能在回归和分类之间切换(如果类按某种方式排序),但这种情况非常罕见。

我建议(在scikit-learn的范围内)是尝试另一种非常强大的分类工具:gradient boostingrandom forest(我最喜欢的),KNeighbors等等。< / p>

之后,您可以计算预测之间的算术或几何平均值,并且大部分时间您将获得更好的结果。

final_prediction = (KNNprediction * RFprediction) ** 0.5