Question

我需要在python3.2中保存一个从matpolotlib生成的图形（上面有8个子图）。我需要保存一个 pdf页面上的数字。 每个子图nmay都有240k到400k的数据点。

我的代码：

from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages
plt.show(block=False)
pp = PdfPages('multipage.pdf')
fig = plt.figure()
fig.savefig('figure_1.pdf', dpi = fig.dpi)
pp.close()

但是，只创建了一个空的pdf文件而且没有数字。任何帮助将不胜感激。

更新这是一个演示代码：

def plot_pdf_example():

    fig = plt.figure() 

    # I create subplots here 
    #x = np.random.rand(50)
    #y = np.random.rand(50)

    plt.plot(x, y, '.')

    fig.savefig('figure_b.pdf')

if __name__ == '__main__':
    r = plot_pdf_example()
    # the return value of r is not 0 for my case
    print("donne")

如果我使用plt.show（）来获取弹出窗口中的数字，则子图之间会有一些标题和图例重叠。如何调整弹出图形以便我可以获得所有子图而不会出现任何重叠，并将所有子图保持为正方形。 保持它们的正方形对我来说非常重要。

Answer 1

您的代码会将单个空图fig保存到文件figure_1.pdf，而不会使用PdfPages。 pdf文件为空也是正常的，因为您没有在fig中绘制任何内容。下面是一个MWE，它显示了如何只将一个数字保存到单个pdf文件中。我删除了PdfPages所有不必要的东西。

更新（2015-07-27）：当将图形保存为pdf时出现问题，因为要渲染的数据太多，或者在复杂和详细的色彩映射的情况下，它可能是一个好主意是栅格化一些有问题的情节元素。下面的MWE已经更新，以反映这一点。

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import time

plt.close("all")

fig = plt.figure()

N = 400000   
x = np.random.rand(400000)
y = np.random.rand(400000)
colors = np.random.rand(400000)
area = 3

ax0 = fig.add_axes([0.1, 0.1, 0.85, 0.85])

scater = ax0.scatter(x, y, s=area, c=colors)
scater.set_rasterized(True)

plt.show(block=False)

ts = time.clock()
fig.savefig('figure_1.pdf')
te = time.clock()

print('t = %f sec' % (te-ts))

在我的机器上，当scater将栅格化设置为true时，上面的代码大约需要6.5秒来保存pdf，而当它设置为False时需要61.5秒。

默认情况下，以pdf格式保存时，图形会保存在vectorial format中。这意味着每个点都保存为一组参数（颜色，大小，位置等）。当存在大量数据时（OP的情况下为8 * 400k），这是存储的大量信息。将绘图的某些元素转换为raster format时，绘制的点数无关紧要，因为图像将保存为固定数量的像素（如png中）。通过仅栅格化scater，图形的其余部分（轴，标签，文本，图例等）仍然保持矢量格式。总的来说，对于某些类型的图形（如彩色图或散点图）而言，质量损失并不那么明显，但对于具有清晰线条的图形而言，质量损失并不明显。

当带有子图的图形从python3.2中的matpolotlib保存为pdf时创建的空pdf

1 个答案: